單細(xì)胞多組學(xué)測序主要包含細(xì)胞分離、文庫構(gòu)建、高通量測序和生物信息學(xué)分析等步驟.因此,單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)的發(fā)展也為相關(guān)算法的開發(fā)帶來了機遇和挑戰(zhàn)。利用多模態(tài)計算方法不僅可以更好地進(jìn)行細(xì)胞分群和譜系追蹤,還可以推斷基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和解析細(xì)胞在組織中的空間位置等信息。多組學(xué)的聯(lián)合分析需要解決的計算問題是如何將大量單細(xì)胞產(chǎn)生的多種不同的組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行有效地生成、識別、整合與分析,并且降低數(shù)據(jù)背景噪音和樣本間的批次差異.目前,單細(xì)胞多組學(xué)的生物信息分析方法仍有待發(fā)展,面臨著諸多問題與挑戰(zhàn)。單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)方法的不斷 發(fā)展和改進(jìn), 為單細(xì)胞層級的多組學(xué)整合分析奠定了 基礎(chǔ)。合肥scRNA單細(xì)胞多組學(xué)

當(dāng)下，單細(xì)胞測序已經(jīng)廣泛應(yīng)用于多種疾病發(fā)展過程中的關(guān)鍵過程和事件，如疾病從輕癥病變向惡性的轉(zhuǎn)化、惡性向轉(zhuǎn)移病變的發(fā)展，以及疾病對多種藥物的反應(yīng)等等。單細(xì)胞測序技術(shù)作為一個需要將組織解離成為單細(xì)胞懸液，或者是采用細(xì)胞核捕獲的策略捕獲單細(xì)胞核，進(jìn)而對于每一個單細(xì)胞或者細(xì)胞核進(jìn)行測序得到結(jié)果的技術(shù)，其空間定位信息是丟失的。這就衍生出了一個問題就是如果單細(xì)胞A與B并不出現(xiàn)在一個組織區(qū)域中他們會互相影響或者轉(zhuǎn)化么？免疫研究中，兩個具有非常強的PDL1-PD1的配對關(guān)系的細(xì)胞在組織切片上風(fēng)馬牛不相及，這樣PDL1-PD1的關(guān)系會生效么？青島烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)多組學(xué)測序烈冰測序數(shù)據(jù)分析平臺，不依賴已有物種信息，可研究非模式物種，針對不同平臺的數(shù)據(jù)，制定多套流程。

從單細(xì)胞測序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類型的功能解析，越來越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角。通過單細(xì)胞多組學(xué)——即對不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個單細(xì)胞來源中檢測多種細(xì)胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)、細(xì)胞表面蛋白表達(dá)、免疫組庫序列（包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體）以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個實驗可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù)，研究人員的獲益更多，包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力、減少因批次效應(yīng)引起的錯誤，并節(jié)省更多的高科技資源（從資助基金到人員時間）。單細(xì)胞測序因其強大的探究疾病--細(xì)胞--基因的關(guān)系，一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”。

如在現(xiàn)有研究方法基礎(chǔ)上，進(jìn)行特定亞細(xì)胞區(qū)域的蛋白質(zhì)組學(xué)、相互作用蛋白質(zhì)組學(xué)以及某種特定翻譯后修飾類型的蛋白質(zhì)組學(xué)的研究等。這將有助于諸多生化過程以及致病機理的全新認(rèn)識與發(fā)現(xiàn)。隨著基于單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜研究方法的不斷發(fā)展，單細(xì)胞分析方法的靈敏度、蛋白質(zhì)的覆蓋度、細(xì)胞通量、空間分辨率以及多組學(xué)的兼容能力會不斷突破我們的認(rèn)知極限。更重要的是，單細(xì)胞分析在臨床診斷、疾病分型以及細(xì)胞發(fā)展機制這些重大生命科學(xué)領(lǐng)域方面的應(yīng)用將會越來越大。單細(xì)胞多組學(xué)數(shù)據(jù)整合的一大挑戰(zhàn)在于不同組學(xué)的特征空間存在差異。

分子檢測型單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)中也有一些集中于探究單細(xì)胞內(nèi)表觀遺傳組各層面的變化及關(guān)聯(lián)。功能研究型單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù),結(jié)合了強大的CRISPR基因編輯技術(shù),從而可以深度挖掘基因表達(dá)調(diào)控與細(xì)胞功能以及命運決定之間的因果關(guān)系。在未來,為了更系統(tǒng)地研究多層組學(xué)之間的互動關(guān)系對細(xì)胞命運的影響,一方面,單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)的策略會繼續(xù)向轉(zhuǎn)錄組結(jié)合其他多個組學(xué)的三組學(xué)甚至四組學(xué)方向發(fā)展.另一方面,單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)會轉(zhuǎn)向研發(fā)多組學(xué)測序分析和功能驗證同時進(jìn)行的方法,這種探究因果關(guān)系的策略對于揭示發(fā)育和疾病發(fā)展中的關(guān)鍵因子和分子網(wǎng)絡(luò)模塊十分重要。單細(xì)胞多組學(xué) 測序技術(shù)會轉(zhuǎn)向研發(fā)多組學(xué)測序分析和功能驗證同時 進(jìn)行的方法。合肥烈冰單細(xì)胞多組學(xué)多組學(xué)測序

單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)是在單細(xì)胞分辨率下精確分析細(xì)胞異質(zhì)性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的新技術(shù)。合肥scRNA單細(xì)胞多組學(xué)

FluidigmC1平臺基于富魯達(dá)（Fluidigm®）的微流控技術(shù)應(yīng)用于單細(xì)胞測序（SingleCellRNASequencing）領(lǐng)域的商業(yè)化中，該技術(shù)大約在幾個小時中可以捕獲96個左右的細(xì)胞，進(jìn)行各類的Single-Cell測序建庫。當(dāng)然，通量還是比較小。但不可否認(rèn)的是，現(xiàn)在很多非RNA類SingleCell測序，仍然在采用這樣的技術(shù)，如SingleCellDNA-Seq，SingleCellATAC-Seq等，都是采用此技術(shù)進(jìn)行單細(xì)胞分選后再分別用不同試劑盒建庫。所以可以說，至少在10XGenomics、BD或者其他企業(yè)推出有效的SingleDNA測序技術(shù)之前，C1仍然會是市場上的重要組成部分。合肥scRNA單細(xì)胞多組學(xué)

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