不同基因zhiliao產(chǎn)品的特殊考慮。關(guān)于整合性載體的特殊考慮如受試者接受整合性載體基因zhiliao產(chǎn)品,例如轉(zhuǎn)座子元件、γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒及其他逆轉(zhuǎn)錄病毒載體,或利用整合性載體或基于轉(zhuǎn)座子的載體在體外修飾的細(xì)胞,長期隨訪中需格外關(guān)注基因zhiliao產(chǎn)品的基因組整合風(fēng)險,建議申辦方分析基因zhiliao載體在靶細(xì)胞或相關(guān)替代細(xì)胞的基因組中整合的影響(例如是否存在克隆性生長、是否存在優(yōu)勢克隆、克隆性生長是否導(dǎo)致惡性liu等)。如果基因組整合相關(guān)風(fēng)險的分析可行,應(yīng)注意以下幾點:?在接受基因zhiliao產(chǎn)品的較初5年內(nèi),兩次檢測間的采樣間隔建議不超過6個月。此后每年至少檢測一次,直至檢測數(shù)據(jù)表明不再存在任何安全性風(fēng)險。脫靶檢測guide-sequence,推薦唯可生物,實驗實力強,專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。杭州off-target脫靶檢測企業(yè)
對于基因修飾細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品,充分的非臨床研究是為了:(1)闡明基因修飾的目的、功能以及產(chǎn)品的作用機(jī)制,明確其在擬定患者人群中使用的生物學(xué)合理性;(2)為臨床試驗的給藥途徑、給藥程序、給藥劑量的選擇提供支持性依據(jù);(3)根據(jù)潛在風(fēng)險因素,闡明毒性反應(yīng)特征,預(yù)測人體可能出現(xiàn)的不良反應(yīng),確定不良反應(yīng)的臨床監(jiān)測指標(biāo),為制定臨床風(fēng)險控制措施提供參考依據(jù)。因此,應(yīng)充分開展非臨床研究,收集用于風(fēng)險獲益評估的信息,以確立擬開發(fā)產(chǎn)品在目標(biāo)患者人群中預(yù)期具有合理的、可接受的獲益風(fēng)險比,同時為臨床試驗的設(shè)計和風(fēng)險控制策略的制定提供支持性依據(jù)。浙江定量脫靶檢測如何檢測是否發(fā)生脫靶? 基因編輯的脫靶率檢測一般有兩種方法。
目前鼓潤已掌握了該項技術(shù),簡述如下:1、CRISPR與dsODNtag整合的實驗技術(shù)及高通量測序建庫流程將靶向于目標(biāo)基因組位點的CRISPR質(zhì)粒與dsODNtag以核電轉(zhuǎn)的方式同時轉(zhuǎn)染入真核細(xì)胞,CRISPR造成基因組雙鏈斷裂后,dsODNtag將整合入斷點處,作為后續(xù)分析在靶與脫靶情況的標(biāo)記。轉(zhuǎn)染后3天收集細(xì)胞的DNA進(jìn)行高通量建庫。2、GUIDE-seq生信分析方法1)搭建了高通量測序的數(shù)據(jù)分析流程。2)利用該技術(shù)分析了CRISPR靶向編輯某細(xì)胞系基因的在靶與脫靶情況。其中一例樣品的分析結(jié)果如圖4所示:Sequencesofoff-targetsitesidentifiedbyGUIDE-seq.Theintendedtargetsequenceisshowninthetoplinewithcleavedsitesshownunderneathandwithmismatchestotheon-targetsiteshownandhighlightedincolor.GUIDE-seqsequencingreadcountsareshowntotherightofeachsite.3)利用PCR擴(kuò)增技術(shù)聯(lián)合Sanger測序鑒定了分析出的脫靶位點。
對于CAR修飾的免疫細(xì)胞,應(yīng)采用多種體外方法評估其胞外抗原識別區(qū)的脫靶風(fēng)險。TCR修飾免疫細(xì)胞的脫靶毒性可通過評估TCR與人體自身抗原肽的交叉識別能力來評估。首先,應(yīng)采用體外試驗測定TCR修飾的免疫細(xì)胞與人自身抗原肽-HLA(與遞呈靶抗原肽的HLA等位基因相同)復(fù)合物的親和力,并說明抗原肽的選擇依據(jù)及選擇范圍。此外,還應(yīng)研究其他相關(guān)或不相關(guān)的蛋白中是否含有靶抗原肽序列。如果TCR與人自身抗原肽有交叉反應(yīng)可能,應(yīng)確定靶抗原肽的較小識別基序(motif),并采用計算機(jī)預(yù)測分析評估交叉反應(yīng)性。如果計算機(jī)預(yù)測可識別出具有潛在交叉反應(yīng)性的抗原肽,應(yīng)在體外測定TCR修飾免疫細(xì)胞對表達(dá)相應(yīng)蛋白或遞呈相應(yīng)抗原肽的的細(xì)胞的識別能力。如果不能排除交叉反應(yīng)性,應(yīng)基于含有潛在交叉反應(yīng)性抗原肽的蛋白的表達(dá)模式以及TCR與潛在交叉反應(yīng)性抗原肽的親和力來進(jìn)行風(fēng)險評估。為獲得TCR與其他等位HLA潛在交叉反應(yīng)性的信息,應(yīng)進(jìn)行充分的HLA交叉反應(yīng)性篩選。脫靶檢測實驗室,推薦唯可生物,實驗實力強,專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。
脫落與傳播。對于部分有g(shù)anran或復(fù)制能力的基因zhiliao產(chǎn)品,從受試者者體內(nèi)排出或脫落到自然環(huán)境后,可能會傳播給受試者的密切接觸者,包括患者親屬和醫(yī)護(hù)人員等,進(jìn)而產(chǎn)生病毒傳播或ganran風(fēng)險。其他考慮因素。除產(chǎn)品相關(guān)因素外,基因zhiliao產(chǎn)品的長期風(fēng)險評估還應(yīng)考慮靶細(xì)胞/組織/qiguan,患者群體(年齡、免疫狀態(tài)、死亡風(fēng)險等)和相關(guān)疾病的特征以及合并其他zhiliao的影響。如果基因zhiliao產(chǎn)品可在生殖腺、生殖細(xì)胞等組織qiguan中分布并發(fā)揮作用,可能對受試者或其配偶的生育能力、妊娠以及胎兒產(chǎn)生難以預(yù)測的遲發(fā)性影響。通過對DSB的標(biāo)記實現(xiàn)了全基因組無偏脫靶檢測,如IDLVs、BLESS、GUIDE-seq技術(shù)等。crispr脫靶檢測方法
基因編輯治療過程中安全性評價,即脫靶效應(yīng)的檢測。杭州off-target脫靶檢測企業(yè)
采用基因編輯技術(shù)制備的細(xì)胞產(chǎn)品。對于采用基因編輯技術(shù)制備的基因修飾細(xì)胞產(chǎn)品,應(yīng)進(jìn)行體外在靶和脫靶活性評估,以確認(rèn)修飾酶或向?qū)NA對靶基因序列的特異性。在評估基因編輯的脫靶風(fēng)險時,應(yīng)說明所選擇的評價策略的合理性和敏感性。雖然采用計算機(jī)分析預(yù)測基因編輯的潛在脫靶位點,并對潛在脫靶位點進(jìn)行深度測序分析,可用于評估基因編輯的脫靶風(fēng)險;但選擇的評價策略仍應(yīng)包含體外全基因組測序比對,以證明潛在脫靶位點未出現(xiàn)脫靶。此外,在評估脫靶活性時,還應(yīng)評估種屬特異性的差異、細(xì)胞病理生理狀態(tài)的差異或細(xì)胞類型的差異對非臨床數(shù)據(jù)預(yù)測性的影響。必要時,還應(yīng)分析基因編輯對細(xì)胞表型和生理功能的潛在影響。杭州off-target脫靶檢測企業(yè)