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上海蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學鑒定

來源: 發(fā)布時間:2022-04-13

蛋白質(zhì)磷酸化修飾定義?在哺乳動物細胞生命周期中,大約有1/3的蛋白質(zhì)發(fā)生過磷酸化修飾,在脊椎動物基因中,約有5%的基因編碼的蛋白質(zhì)是參與磷酸化和去磷酸化過程的蛋白激酶和磷酸酶。它可以通過激發(fā)、調(diào)節(jié)諸多信號通路進而參與調(diào)控生物體的生長、發(fā)育、逆境應激、疾病發(fā)生等多種生命過程,一直是生物學研究的重點與熱點。蛋白磷酸化是指在激酶催化作用下把ATP或者GTP的磷酸基團(P04)轉(zhuǎn)移到不同種類的氨基酸上(主要包括絲氨酸S、蘇氨酸T、酪氨酸Y),從而使蛋白質(zhì)發(fā)生翻譯后修飾的過程。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾通過可逆的共價鍵將小分子或蛋白質(zhì)與底物蛋白質(zhì)上特定的氨基酸結(jié)合。上海蛋白質(zhì)乙酰化修飾組學鑒定

琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組鑒定:蛋白質(zhì)琥珀?;揎検切陆l(fā)現(xiàn)的一種蛋白質(zhì)翻譯后修飾,是在琥珀酰輔酶 A 的介導下將一個負電荷四碳琥珀?;D(zhuǎn)移到賴氨酸殘基的伯胺上的過程。賴氨酸琥珀?;谡婧思毎霸思毎衅毡榇嬖冢瑓⑴c調(diào)控包括三羧酸循環(huán),氨基酸代謝以及脂肪酸代謝在內(nèi)的多個代謝信號通路。琥珀?;鞍踪|(zhì)組以組織、細胞等較為復雜樣本為研究對象,目的在于鑒定樣品中發(fā)生琥珀?;揎椀牡鞍踪|(zhì)以及相應的琥珀?;揎椢稽c。琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組技術特點:采用主流抗體親和富集方法,特異性高,富集效率好。上海蛋白質(zhì)琥珀?;揎椊M學鑒定蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學有什么重要的作用呢?

琥珀酰化修飾蛋白質(zhì)組技術特點:采用主流抗體親和富集方法,特異性高,富集效率好;通過高分辨率、高掃描速度的質(zhì)譜,對富集的琥珀?;亩芜M行大規(guī)模鑒定;結(jié)合常用的定量技術可對不同樣品間的琥珀酰化水平差異進行定量比較。適用范圍:藥物作用靶點研究;疾病標志物篩選;植物脅迫/抗逆研究;作用機制研究;要求物種具有蛋白質(zhì)參考數(shù)據(jù)庫、EST序列(轉(zhuǎn)錄組)或基因組注釋信息。應用方向:線粒體代謝、生物合成與代謝、中心代謝途徑、炎癥與疾病。

乙?;揎椀鞍捉M學介紹:蛋白質(zhì)乙?;?Acetylation)是蛋白在乙?;D(zhuǎn)移酶(或非酶)的催化下,將乙?;鶊F轉(zhuǎn)移并添加在蛋白賴氨酸殘基或蛋白N端上的過程,在調(diào)控蛋白質(zhì)功能、染色質(zhì)結(jié)構和基因表達中起重要作用。乙?;揎椫饕譃閮深悾旱鞍譔端的乙?;揎椇偷鞍踪嚢彼嵘系囊阴;揎?。N端乙?;揎棿蟛糠职l(fā)生在真核生物的蛋白上,由N乙酰轉(zhuǎn)移酶(NATs)催化;賴氨酸上的乙?;揎検且粋€可逆的過程,主要由賴氨酸乙酰化酶(KATs)和賴氨酸去乙?;?KDACs)催化。蛋白質(zhì)磷酸化修飾的免疫印跡技術優(yōu)點:檢測特異性高。

泛素化修飾蛋白質(zhì)組學的作用:泛素化、心血管等疾病的發(fā)病密切相關。因此,作為近年來生物化學研究的一個重大成果,它已然成為研究、開發(fā)新藥物的新靶點。技術原理是首先將蛋白樣本酶解成肽段混合物,然后使用液相色譜對酶解后的肽段混合物進行組分分離以降低樣本復雜程度,然后通過高質(zhì)量的泛素化修飾抗體和生物材料對修飾肽段進行富集,之后上樣至液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜中進行分析定量。技術優(yōu)勢:高特異性的修飾抗體;高分辨率、高靈敏度質(zhì)譜儀;鑒定通量高;可與代謝組學等進行多組學聯(lián)合分析。目前對乙?;揎椀墓δ苎芯恐饕性趯毎D(zhuǎn)錄調(diào)控,以及對代謝通路的調(diào)控這兩個方面。上海蛋白質(zhì)琥珀酰化修飾組學鑒定

蛋白質(zhì)乙?;彩且环N可逆的酶促反應過程。上海蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學鑒定

蛋白質(zhì)翻譯后修飾:蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (Protein translational modifications,PTMs) 通過功能基團或蛋白質(zhì)的共價添加、調(diào)節(jié)亞基的蛋白水解切割或整個蛋白質(zhì)的降解來增加蛋白質(zhì)組的功能多樣性。這些修飾包括磷酸化、糖基化、泛素化、亞硝基化、甲基化、乙?;?、脂質(zhì)化和蛋白水解,幾乎影響正常細胞生物學和發(fā)病機制的所有方面。因此,識別和理解 PTM 在細胞生物學和疾病療理和預防的研究中至關重要。蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (PTMs) 進一步促進了從基因組水平到蛋白質(zhì)組復雜性的增加。PTMs 是一種化學修飾,在功能蛋白質(zhì)組中發(fā)揮關鍵作用,因為它們調(diào)節(jié)活性、定位以及與其他細胞分子(如蛋白質(zhì)、核酸、脂質(zhì)和輔助因子)的相互作用。上海蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學鑒定