蛋白質(zhì)組學技術(shù)：等電聚焦：等電聚焦（isoelectricfocusing，IEF）是一種利用有pH梯度的介質(zhì)分離等電點不同的蛋白質(zhì)的電泳技術(shù)。等電聚焦凝膠電泳依據(jù)蛋白質(zhì)分子的靜電荷或等電點進行分離，等電聚焦中，蛋白質(zhì)分子在含有載體兩性電解質(zhì)形成的一個連續(xù)而穩(wěn)定的線性pH梯度中電泳。載體兩性電解質(zhì)是脂肪族多氨基多羧酸，在電場中形成正極為酸性，負極為堿性的連續(xù)的pH梯度。蛋白質(zhì)分子在偏離其等電點的pH條件下帶有電荷，因此可以在電場中移動；當?shù)鞍踪|(zhì)遷移至其等電點位置時，其靜電荷數(shù)為零，在電場中不再移動，據(jù)此將蛋白質(zhì)分離。蛋白質(zhì)組（Proteome）一詞，源于蛋白質(zhì)（protein）與基因組（genome）兩個詞的組合。4D定量蛋白質(zhì)組學應用
我們究竟怎么研究蛋白質(zhì)組學呢？目前高通量檢測蛋白質(zhì)的方法中，還是首推基于質(zhì)譜的方法，納流液相可以將復雜樣品中的肽段高效地分離，然后依次進入質(zhì)譜，對每個被離子化的肽段及其碎裂后碎片的荷質(zhì)比進行分析，從而得到該肽段的序列信息，然后根據(jù)對應的色譜峰面積或者報告離子強度等信息，我們又可以得到該肽段的定量信息。蛋白組學研究怎么做？當下蛋白組學研究中應用比較普遍的技術(shù)是同位素標記定量（iTRAQ/TMT技術(shù)）。iTRAQ/TMT技術(shù)是利用DDA掃描模式，其掃描的方式是將一級質(zhì)譜信號比較強的Top20的多肽進行二級打碎，然后進入二級質(zhì)譜進行檢測。其優(yōu)勢是二級譜圖采集的肽段信息都來源于同一條多肽，有利于后續(xù)的定性分析。廣東常規(guī)蛋白質(zhì)組學分析方法目前國際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進行蛋白質(zhì)組學方面的應用性研究。
非標定量法(Label-free)是通過比較質(zhì)譜分析次數(shù)或質(zhì)譜峰強度，分析不同來源樣品蛋白的數(shù)量變化，認為肽段在質(zhì)譜中被捕獲檢測的頻率與其在混合物中的豐度成正相關(guān)，因此蛋白質(zhì)被質(zhì)譜檢測的計數(shù)反映了蛋白質(zhì)的豐度，通過適當?shù)臄?shù)學公式可以將質(zhì)譜檢測計數(shù)與蛋白質(zhì)的量聯(lián)系起來,從而對蛋白質(zhì)進行定量。按照其原理主要分為兩種，第1種spectrumcounts類的非標記方法，發(fā)展比較早，已經(jīng)形成多種定量算法，但是主要的原理都是以MS2的鑒定結(jié)果為定量基礎(chǔ)，各種方法的差別在于后期算法在大規(guī)模數(shù)據(jù)上的修正。第二種非標記定量的原理是以MS1為基礎(chǔ)，計算每個肽段的信號強度在LC-MS上的積分。
蛋白質(zhì)組學，指對某一基因組所表達的所有蛋白質(zhì)及其特征進行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究，以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網(wǎng)絡。研究的內(nèi)容主要包括：組成蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)氨基酸的序列特征、蛋白質(zhì)的豐度、蛋白質(zhì)活性、蛋白質(zhì)的修飾、亞細胞定位和三維結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)之間的相互作用以及對蛋白質(zhì)的高階復合物結(jié)構(gòu)。質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展為這些研究提供了有力的技術(shù)支撐，使得許多有實際應用的蛋白質(zhì)組功能研究成為可能，包括翻譯后修飾的整體分析，蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡的重建和模式生物蛋白表達譜的定量研究；在臨床醫(yī)學和轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究中也越來越多地應用到蛋白質(zhì)組學技術(shù)。蛋白質(zhì)組的概念與基因組的概念有許多差別。
定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)：定量蛋白質(zhì)組學是蛋白質(zhì)組研究的重要內(nèi)容，通過對基因表達產(chǎn)物——蛋白質(zhì)的定量分析，以了解基因在不同的生理、病理和逆境條件下的表達情況。近年來，隨著非凝膠技術(shù)的發(fā)展，蛋白質(zhì)組學（“Shotgun”proteomics）技術(shù)，特別是多維蛋白質(zhì)鑒定（MultidimensionalProteinIdentification，MudPIT）已成為研究復雜生物樣本中大規(guī)模蛋白質(zhì)表達和定性和定量分析的強有力工具。蛋白質(zhì)組學在醫(yī)學的研究應用：蛋白質(zhì)組學是研究細胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學。定量蛋白質(zhì)組學通過對蛋白質(zhì)的定量分析，以了解基因在不同的生理、病理和逆境條件下的表達情況。上海4D定量蛋白質(zhì)組學價格
蛋白質(zhì)組學技術(shù)有等電聚焦。4D定量蛋白質(zhì)組學應用
定量蛋白質(zhì)組學分析（QuantitativeProteomics）是對一個基因組表達的全部蛋白質(zhì)或一個復雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進行精確鑒定和定量。可用于篩選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達蛋白，結(jié)合生物信息學揭示細胞生理病理等功能，同時也可對某些關(guān)鍵蛋白進行定性和定量分析。目前定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)常見標記（Label）和非標記的（LabelFree）定量策略。定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)常見的幾類主要包括：LabelFree定量蛋白組分析、SILAC與免疫共沉淀蛋白互作分析、MRM/PRM定量蛋白組學分析、SILAC/Dimethyl標記定量蛋白組分析、SWATH定量蛋白組學、TMT/iTRAQ/multinotch定量蛋白組學分析。4D定量蛋白質(zhì)組學應用
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