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武漢實時熒光定量PCR原理及步驟

來源: 發(fā)布時間:2022-10-10

聚合酶鏈式反應:三步:變性:模板DNA加熱變性;復性,引物與它的靶序列發(fā)生退火,引物DNA量多,使引物和模板在局部形成雜交鏈;延伸,4種dNTP 與 Mg2+ 存在的條件下,DNA合成酶催化以引物為起始點,按5'-3'方向進行延伸。上面三步為一個循環(huán),可使拷貝數到達2*E-6-2*E-7。PCR產物一段雙鏈DNA,是由它的末端引物的5’端決定的。首輪擴增,其產物是大小不均一的DNA分子。長度應大于兩引物之間的長度。在第二個循環(huán)中,由于5'固定,其產物長度就由等于兩引物之間的長度。所以幾十個循環(huán)后就會產生大量的兩引物之間序列。像所有酶一樣,DNA聚合酶也容易出錯,這反過來會導致產生的PCR片段發(fā)生突變。武漢實時熒光定量PCR原理及步驟

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聚合酶鏈反應的常見問題分析與解決方法:擴增產物出現多條帶(雜帶):引物用量偏大,引物的特異性不高。應調換引物或降低引物的使用量。循環(huán)的次數過多。適當增加模板的量,減少循環(huán)次數。酶的用量偏高或酶的質量不好,應降低酶量或調換另一來源的酶。退火溫度偏低,退火及延伸時間偏長。應提高退火溫度,減少變性與延伸時間,也可采用二種溫度的PCR擴增。以2度為梯度設計梯度PCR反應優(yōu)化退火溫度。 樣品處理不當。Mg2+濃度偏高,因適當調整Mg2+使用濃度。若為PCR試劑盒,也可能時試劑盒本身質量有問題。復制提前終止。使用非熱啟動的聚合酶時常有發(fā)生。冰上準備反應體系或采用熱啟動聚合酶。南通細胞數字PCR網站聚合酶鏈反應非常敏感,有可能產生數百萬到數十億份特定產品的拷貝,用于測序、克隆和分析。

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聚合酶鏈式反應:1976年,中國科學家,發(fā)現了穩(wěn)定的Taq DNA聚合酶,為PCR技術發(fā)展也做出了基礎性貢獻。PCR是利用DNA在體外攝氏95°高溫時變性會變成單鏈,低溫(經常是60°C左右)時引物與單鏈按堿基互補配對的原則結合,標本核酸模板在提取過程中,由于吸樣污染導致標本間污染;有些微生物標本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴散再調溫度至DNA聚合酶很適反應溫度(72°C左右),DNA聚合酶沿著磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互補鏈?;诰酆厦钢圃斓腜CR儀實際就是一個溫控設備,能在變性溫度,復性溫度,延伸溫度之間很好地進行控制。

聚合酶鏈式反應:DNA的半保留復制是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解旋成單鏈,在DNA聚合酶的參與下,根據堿基互補配對原則復制成同樣的兩分子拷貝。在實驗中發(fā)現,DNA在高溫時也可以發(fā)生變性解鏈,當溫度降低后又可以復性成為雙鏈。因此,通過溫度變化控制DNA的變性和復性,加入設計引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復制。但是,DNA聚合酶在高溫時會失活,因此,每次循環(huán)都得加入新的DNA聚合酶,不但操作煩瑣,而且價格昂貴,制約了PCR技術的應用和發(fā)展。耐熱DNA聚合酶-Taq酶的發(fā)現對于PCR的應用有里程碑的意義,該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活,不需要每個循環(huán)加酶,使PCR技術變得非常簡捷、同時也降低了成本,PCR技術得以大量應用,并逐步應用于臨床。聚合酶鏈式反應準備:引物內部不應出現互補序列。

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聚合酶鏈式反應的常見問題:靶序列變異:如靶序列發(fā)生突變或缺失,影響引物與模板特異性結合,或因靶序列某 段缺失使引物與模板失去互補序列,其PCR擴增是不會成功的。假陽性:出現的PCR擴增條帶與目的靶序列條帶一致,有時其條帶更整齊,亮度更高。引物設計不合適:選擇的擴增序列與非目的擴增序列有同源性,因而在進行PCR擴增時,擴增出的PCR產物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出現假陽性。需重新設計引物。出現片狀拖帶或涂抹帶:PCR擴增有時出現涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶。其原因往往由于酶量過多或酶的質量差,dNTP濃度過高,Mg2+濃度過高,退火溫度過低,循環(huán)次數過多引起。其對策有:減少酶量,或調換另一來源的酶。②減少dNTP的濃度。適當降低Mg2+濃 度。增加模板量,減少循環(huán)次數。聚合酶鏈式反應的引物與非特異擴增區(qū)的序列的同源性不要超過70%。溫州血液熒光PCR技術服務

重疊延伸聚合酶鏈反應可以將缺失、插入或點突變引入DNA序列。武漢實時熒光定量PCR原理及步驟

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