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合肥單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-09-13

樣本制備后的保存為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,在對(duì)細(xì)胞進(jìn)行清洗和計(jì)數(shù)后,單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上,直至用于后續(xù)的上機(jī)和文庫(kù)制備步驟。在理想狀況下,一旦制備好樣本,應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而,您還有必要了解各類細(xì)胞的不同性質(zhì),因?yàn)檫@可能會(huì)影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時(shí)間,以及它們?cè)谥苽浜蠖嗑帽銘?yīng)當(dāng)被盡快使用。例如,有些細(xì)胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時(shí)間,它們就開(kāi)始形成團(tuán)塊。這些團(tuán)塊很難解離,增加了堵塞的風(fēng)險(xiǎn),而且每個(gè)團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計(jì)數(shù),又降低了細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性。此外,有些細(xì)胞更加粘稠,形成團(tuán)塊的速度更快。對(duì)于這些細(xì)胞,必須盡量減少制備和使用之間的時(shí)間差。單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類型。合肥單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序

根據(jù)烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn),為什么不建議您一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲:?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進(jìn)行,而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后,獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜,通過(guò)降維(pca),無(wú)監(jiān)督聚類以及可視化(t-SNE)得到的。進(jìn)行細(xì)胞聚類時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式,因此即使是相同的數(shù)據(jù),在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下,前后獲得的聚類圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過(guò)多時(shí),無(wú)論是假陰性和假陽(yáng)性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù),都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類產(chǎn)生影響,造成聚類結(jié)果失真。這也是很多文章,特別是很多高分文章,為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個(gè)時(shí),數(shù)據(jù)量在100G左右時(shí),可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求。深圳BD單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序基于磁珠Barcode和UMI及polyT的探針結(jié)構(gòu),精細(xì)區(qū)分上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞中mRNA的來(lái)源及表達(dá)豐度。

作為單細(xì)胞測(cè)序的又一個(gè)重要里程碑,BDRhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)整合了儀器、試劑盒和基礎(chǔ)信息學(xué)軟件,能精確對(duì)接illumina測(cè)序儀,因此可實(shí)現(xiàn)大量大細(xì)胞的快速高效標(biāo)記、測(cè)序和分析,獲得單細(xì)胞水平的基因表達(dá)譜和差異情況,并通過(guò)對(duì)復(fù)雜細(xì)胞群體進(jìn)行深入細(xì)致分析,繪制大規(guī)模單細(xì)胞表達(dá)圖譜。以量化細(xì)胞內(nèi)的群體異質(zhì)性,并逐個(gè)鑒定細(xì)胞類型、細(xì)胞狀態(tài)和動(dòng)態(tài)細(xì)胞躍遷。除了有望鑒定新的細(xì)胞亞型和稀有細(xì)胞群體,單細(xì)胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動(dòng)態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系。

單細(xì)胞測(cè)序方法不但改進(jìn)了實(shí)驗(yàn)過(guò)程,還幫助科學(xué)家在健康和疾病研究的關(guān)鍵領(lǐng)域取得新進(jìn)展。那些過(guò)去從轉(zhuǎn)錄平均值或單項(xiàng)參數(shù)讀取中無(wú)法獲得的新發(fā)現(xiàn)正在改變我們對(duì)傳染病、神經(jīng)退行性疾病等疾病的認(rèn)識(shí)。從鑒定新的細(xì)胞類型和狀態(tài),到揭開(kāi)疾病用藥應(yīng)答和耐藥的潛在機(jī)制,單細(xì)胞測(cè)序正在推動(dòng)突破性的研究,有望改變生物學(xué)和醫(yī)療。無(wú)論是無(wú)法解釋的疾病,還是人體或自然界中尚未探索的系統(tǒng),曾經(jīng)模糊的東西正變得越來(lái)越清晰。隨著我們邁向科學(xué)的未來(lái),我們手頭的工具就像伽利略的望遠(yuǎn)鏡一樣能夠提高焦距和放大倍數(shù),而定義科學(xué)未來(lái)的知識(shí)新深度是十年前的人們所無(wú)法想象的。BD 單細(xì)胞捕獲平臺(tái)搭配BD Scanner,全流程實(shí)時(shí)質(zhì)控,項(xiàng)目質(zhì)量盡在掌握。

烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測(cè)序行業(yè),為科研學(xué)者提供專注的測(cè)序數(shù)據(jù)分析服務(wù),先后經(jīng)歷基因芯片時(shí)代、基因測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序時(shí)代...在科技日新月異的洪流中始終獨(dú)占鰲頭。2018年以來(lái),單細(xì)胞測(cè)序進(jìn)入發(fā)展的快車道,烈冰作為國(guó)內(nèi)首批引進(jìn)單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)雙平臺(tái)的公司,依托自主研發(fā)的NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),為用戶提供一站式全流程的單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)和解決方案。4年的單細(xì)胞技術(shù)的積累,烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚(yú)、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種,皮膚、腦、脂肪、心臟、花序等50+組織類型,100+細(xì)胞類型,1000+靶標(biāo)基因,10000+樣本處理經(jīng)驗(yàn)。烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000,開(kāi)啟更大通量測(cè)序新紀(jì)元。廣州BD單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序

BD單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)同時(shí)兼容單細(xì)胞蛋白組測(cè)序(Ab-seq)和免疫組庫(kù)測(cè)序等工作。合肥單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序

一體化的結(jié)構(gòu)體系難以形成,我國(guó)醫(yī)藥健康正處于初級(jí)發(fā)展階段,與體系健全的發(fā)達(dá)地區(qū)相比,冷鏈物流行業(yè)呈現(xiàn)規(guī)模小且分布雜亂的現(xiàn)象。醫(yī)藥行業(yè)上下游未整體規(guī)劃,成為我國(guó)冷鏈物流發(fā)展的障礙,從而使得醫(yī)藥冷鏈物流流通效率低下。以單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序?yàn)槔?,主打運(yùn)動(dòng)健康A(chǔ)PP停留在工具層面,缺少完整的消費(fèi)場(chǎng)景閉環(huán),較強(qiáng)的工具屬性停留在實(shí)現(xiàn)用戶基礎(chǔ)的功能需求,并未涉及足夠高的用戶使用價(jià)值實(shí)現(xiàn),同時(shí)缺乏數(shù)字化運(yùn)營(yíng)的效能也是運(yùn)動(dòng)健康A(chǔ)PP發(fā)展的明顯桎梏,經(jīng)營(yíng)模式有待進(jìn)一步探索。服務(wù)型項(xiàng)目新市場(chǎng)加入通常耗資巨大,單一的資本進(jìn)入往往會(huì)形成極大的資本壓力,因此一些重大的服務(wù)型項(xiàng)目往往都會(huì)通過(guò)數(shù)家有實(shí)力的資本進(jìn)行組合資本。醫(yī)藥健康上下游未整體規(guī)劃,醫(yī)用物流公司十分分散,許多下游需求店鋪及用戶因物流體系不完善而放棄該種醫(yī)藥的引入和使用。由于醫(yī)用藥保存條件要求十分高,存儲(chǔ)倉(cāng)庫(kù)與冷藏運(yùn)輸車等的建設(shè)與運(yùn)行成本便居高不下,使得醫(yī)藥冷鏈物流從建設(shè)到運(yùn)營(yíng)中的成本都遠(yuǎn)超于傳統(tǒng)物流成本。合肥單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序

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