烈冰生物為您的實驗定制工作流程: 對于不同用戶和實驗,單細胞實驗工作流程往往需要不同程度的樣本操作、質(zhì)量和通量。BD儀器選項可以根據(jù)具體需求進行配置。烈冰生物搭建BD FACS流式分選平臺(如 BD FACSMelody),是上游樣本富集的良好選擇。此外,我們具備BD Rhapsody單細胞成像儀提供自動化細胞計數(shù)和細胞樣本活性測試,幫助用戶制備適用于Cartridge微孔板單細胞捕獲濃度的樣本。掃描儀提供了微孔板上磁珠捕獲細胞的計數(shù)。BD Rhapsody 樣品上樣工作站輕巧便攜,可在實驗室內(nèi)輕松移動。搭配烈冰傾情研發(fā)多年的成果NovelBrain生物信息大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng),完成測序數(shù)據(jù)的生物信息分析和結(jié)果可視化呈現(xiàn)。這些工具包括 UMI 分析算法和可視化工具,即使沒有經(jīng)驗的用戶也可分析和理解單細胞數(shù)據(jù)?;凇办o態(tài)蜂巢”技術(shù),實現(xiàn)落孔細胞的物力分割和磁珠的一對一匹配。北京single cell RNA單細胞測序服務(wù)
樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,在對細胞進行清洗和計數(shù)后,單細胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上,直至用于后續(xù)的上機和文庫制備步驟。在理想狀況下,一旦制備好樣本,應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而,您還有必要了解各類細胞的不同性質(zhì),因為這可能會影響細胞應(yīng)在冰上保存的時間,以及它們在制備后多久便應(yīng)當(dāng)被盡快使用。例如,有些細胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時間,它們就開始形成團塊。這些團塊很難解離,增加了堵塞的風(fēng)險,而且每個團塊被當(dāng)成單細胞計數(shù),又降低了細胞計數(shù)的準確性。此外,有些細胞更加粘稠,形成團塊的速度更快。對于這些細胞,必須盡量減少制備和使用之間的時間差。溫州scRNA單細胞平臺單細胞測序平臺,烈冰提供高性價比服務(wù)方案。
針對單細胞測序的細胞上樣數(shù),為什么不建議捕獲到的細胞數(shù)量越高越好?一味地追求高數(shù)量的細胞捕獲可能會存在一些問題。例如在上機細胞懸液濃度固定時,如果目標(biāo)細胞捕獲數(shù)增加到8000甚至10000,上樣細胞懸液體積勢必增加,在細胞懸液質(zhì)量不是很理想(細胞活性<90%、碎片率>5%、結(jié)團率均>5%)的情況下,引入的背景信號會增加,分析結(jié)果不理想的直接體現(xiàn)包括:cell、non-cell無法有效區(qū)分和Fraction reads in cells偏低。當(dāng)cell和non-cell無法有效區(qū)分時,會使得數(shù)據(jù)出現(xiàn)假陽性和假陰性結(jié)果!當(dāng)目標(biāo)細胞捕獲數(shù)很大時,多細胞率會增加,數(shù)據(jù)分析時,此部分“cell”表現(xiàn)為基因檢測數(shù)和UMI檢測數(shù)是正常cell的N倍(N是一個GEM包裹的細胞數(shù)),導(dǎo)致所有細胞的統(tǒng)計數(shù)據(jù)(單個細胞基因檢測中位數(shù)、單個細胞UMI檢測中位數(shù))虛高。此部分“cell”雖然可以通過設(shè)置數(shù)據(jù)分析閾值進行過濾,但是容易會有此類數(shù)據(jù)的殘留和正常高基因檢測細胞的人為去除!
單細胞測序技術(shù)(Single Cell Sequencing)從一種新興的研究角度,借助已有的高通量測序手段,幫助研究者在樣本中細胞的異質(zhì)性、免疫微環(huán)境、發(fā)育學(xué)、免疫學(xué)以及其他領(lǐng)域中進行單細胞層面的數(shù)據(jù)解析,解決了Bulk Population Sequencing所無法解決的問題。這樣一個新的研究領(lǐng)域必然也需要足夠可靠的實驗手段來支撐。BD Rhapsody單細胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設(shè)備,保證了從單細胞懸液質(zhì)量評估到單細胞分選標(biāo)記過程中每一個實驗步驟的準確質(zhì)控。NovelBio單細胞實驗團隊借助BD Rhapsody單細胞分選系統(tǒng),在實驗實施層面對單細胞測序結(jié)果的可靠性提供了強有力的保證。繼單細胞懸液制備之后,又在另一道關(guān)鍵關(guān)卡提供了可靠的支持,幫助研究者在單細胞測序領(lǐng)域收獲更多的成果。烈冰科技已建立了多種國際和國內(nèi)主流的高通量測序?qū)嶒炂脚_和自主研發(fā)國產(chǎn)化實驗平臺。
烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!此外,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(Single Cell Browser),不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,還是可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您,詳情請咨詢烈冰生物。烈冰生物全國五大實驗中心,多地部署B(yǎng)D Rahpsody平臺,助您的樣本更快速抵達“戰(zhàn)場”。杭州scRNA單細胞測序
高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次突破性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。北京single cell RNA單細胞測序服務(wù)
烈冰生物單細胞測序服務(wù)體系,不僅提供10X Genomics和BD Rhapsody兩大國際認可的單細胞實驗平臺,在“附加”產(chǎn)品上,我們提供BD FACS Melody流式細胞儀,滿足您對特殊細胞類型的富集需求,自主研發(fā)的Panocell單細胞捕獲芯片,可兼容BD 平臺全套原裝磁珠、試劑和protocol,為您提供完整的單細胞多組學(xué)解決方案。從細胞多樣本分析和染色所需的試劑到檢測試劑盒,生物信息分析工具,和在線大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)、精簡方案和專業(yè)團隊技術(shù)支持,烈冰生物可為您提供用于單細胞多組學(xué)甚至到空間轉(zhuǎn)錄組測序的各種工具,助您加速科研探索之旅。北京single cell RNA單細胞測序服務(wù)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,以科技創(chuàng)新實現(xiàn)高品質(zhì)管理的追求。烈冰生物作為生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),計算機、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的企業(yè)之一,為客戶提供良好的單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學(xué)測序。烈冰生物繼續(xù)堅定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路,既要實現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長,又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域,實現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。烈冰生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場,以敏銳的市場洞察力,實現(xiàn)與客戶的成長共贏。