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北京BD單細胞實驗服務(wù)

來源: 發(fā)布時間:2022-07-08

為什么需要單細胞分辨率? 生物學就像宇宙一樣。它非常復(fù)雜,有許多獨特的單體,也就是細胞。這些細胞相互作用并扮演不同的角色,在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動多個過程。就像伽利略探索宇宙的努力一樣,發(fā)現(xiàn)和定義這些細胞也需要高分辨率的工具,才能解開促成生物學復(fù)雜性的基因表達異質(zhì)性。單細胞測序能夠在以一個細胞為功能單位中開展生物學研究,闡明具體細節(jié),構(gòu)建出一幅更大、更精細的圖譜,說明導致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細胞之間是如何相互作用的:患者為什么會復(fù)發(fā)?是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題。搭建多種測序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺,5000+項目檢驗,真實可信賴。北京BD單細胞實驗服務(wù)

烈冰生物BD Rhapsody平臺,采用精簡的工作流程助力您的實驗成功: 1.制備單細胞懸液:可使用碧迪醫(yī)療單細胞多樣本分析試劑盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶聯(lián)抗體( Ab-Oligos)將細胞染色 2.微孔板預(yù)充和處理:使用自動移液器進行液體交換 3.單細胞捕獲工作流程: (1)細胞上樣:上樣 575微升細胞懸液;系統(tǒng)未采用微流體通道設(shè)計,無需擔心通道堵寨;通過重力輕輕沉淀細胞,可捕獲脆弱細胞,BD Rhapsody微孔板包含大于220,000個分區(qū),可在低雙細胞率下捕獲多達40000個細胞 (2)細胞上樣掃描:估算捕獲的活細胞數(shù)量和細胞多態(tài)率 (3)磁珠上樣:微孔的正六邊形幾何形狀和尺寸可防止磁珠多重分配在微孔中 (4)磁珠上樣和磁珠洗滌掃描:估算包含活細胞和磁珠的微孔數(shù)量;測定細胞存留率,評估是否發(fā)生細胞損失 (5)細胞裂解:使用裂解緩沖液,確保細胞完全裂解 (6)磁珠回收:輕松、高效地磁性回收磁珠并采用Scanner掃描磁珠回收情況湖南BD VDJ單細胞測序單細胞測序因其強大的探究疾病--細胞--基因的關(guān)系,一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”。

烈冰與國內(nèi)高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,服務(wù)于600+臨床與研究機構(gòu),1000+客戶和5000+重要科研項目,助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學術(shù)期刊(不完全統(tǒng)計),在單細胞領(lǐng)域,烈冰助力用戶發(fā)表單細胞文獻30+篇,總IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,包含Immunity、Nature Cell Biology、Nature Plants 、Advanced Science等生物領(lǐng)域國際主流學術(shù)期刊,已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機制,免疫研究、腦神經(jīng)、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等。

根據(jù)烈冰多年單細胞測序服務(wù)經(jīng)驗,為什么不建議您一味的追求高細胞數(shù)量的捕獲:單細胞測序所有的分析都是基于細胞聚類進行,而細胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后,獲得細胞基因表達譜,通過降維(pca),無監(jiān)督聚類以及可視化(t-SNE)得到的。進行細胞聚類時需要考慮到每個細胞的基因表達模式,因此即使是相同的數(shù)據(jù),在剔除幾個細胞的情況下,前后獲得的聚類圖也會出現(xiàn)明顯不同。而當細胞捕獲數(shù)過多時,無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細胞數(shù)據(jù),都會對正常細胞聚類產(chǎn)生影響,造成聚類結(jié)果失真。這也是很多文章,特別是很多高分文章,為什么單個樣本捕獲細胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個樣本捕獲細胞數(shù)在3000-5000個時,數(shù)據(jù)量在100G左右時,可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求。搭配BD FACSMelody流式分選儀,全線搭建BD Rahpsody單細胞測序平臺。

關(guān)于單細胞測序?qū)嶒灅颖局苽?,這與流式細胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致,也就是通過酶促或機械消化、細胞分選或其他細胞分離技術(shù)從整個樣本中制備生成活的單細胞懸液。隨后是細胞計數(shù)和質(zhì)量控制步驟,以確保您的樣本有適當濃度的活細胞,并且不含細胞團塊和死細胞碎片。如有必要,您還可以使用抗體對樣本進行染色,標記細胞表面蛋白或其他生物分析物,或者通過FACS來富集感興趣的細胞類型。解離樣本時采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實驗?zāi)繕硕āR苍S需要額外的制備步驟,具體取決于組織質(zhì)量、樣本豐度、細胞大小,以及是否需要提取出細胞核進行染色質(zhì)可接近性分析。無論具體的考慮因素如何,所有樣本類型都遵循同一個基本原則,那就是生成高質(zhì)量的單細胞懸液。深度的單細胞測序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時代。四川BD單細胞轉(zhuǎn)錄組測序

BD Rhapsody平臺在細胞捕獲過程中沒有偏好性,可同樣無差別捕獲中性粒細胞。北京BD單細胞實驗服務(wù)

針對單細胞測序數(shù)據(jù)分析時的reads數(shù)、基因表達量及細胞數(shù)量判定過程中:以捕獲5000個細胞、100G的測序量為標準,每個細胞的reads數(shù)大約在50k左右;每個細胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細胞類型,例如成熟的B,T,粒細胞數(shù)量較多的組織中,由于該類型細胞表達的基因數(shù)普遍較少,導致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細胞等,他們的基因表達數(shù)較高,甚至可以超過1W,這就導致該類樣本基因中位數(shù)非常高。因此,我們對細胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認時,需要考察實際組織的細胞組成。北京BD單細胞實驗服務(wù)

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司總部位于江月路999號奇亞特中心22幢,是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),計算機、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的公司。烈冰生物深耕行業(yè)多年,始終以客戶的需求為向?qū)В瑸榭蛻籼峁└咂焚|(zhì)的單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學測序。烈冰生物繼續(xù)堅定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路,既要實現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長,又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域,實現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。烈冰生物創(chuàng)始人陳岱,始終關(guān)注客戶,創(chuàng)新科技,竭誠為客戶提供良好的服務(wù)。