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南京BD單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-06-02

單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽,需要對(duì)細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進(jìn)行準(zhǔn)確判斷,這對(duì)Single Cell分選標(biāo)記、建庫(kù)、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高,將會(huì)影響建庫(kù)的成功率;計(jì)數(shù)偏低,則會(huì)顯著提高雙細(xì)胞的比例;而細(xì)胞活率過(guò)低,就會(huì)使測(cè)序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要。而在鋪板過(guò)程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果。因此烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分選平臺(tái)配套了專門定制的電動(dòng)移液器,其具有Prime Treat、Cell Load、Bead Load、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式,來(lái)對(duì)應(yīng)各種不同的操作。通過(guò)已經(jīng)設(shè)定的程序來(lái)控制液體的流速,大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來(lái)的差異,保證實(shí)驗(yàn)操作的一致性。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)遍地開(kāi)花,烈冰服務(wù)讓您的生物醫(yī)學(xué)研究如虎添翼。南京BD單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的數(shù)據(jù)質(zhì)量和玻片有效區(qū)域的利用率、貼片的質(zhì)量和透化時(shí)間息息相關(guān)。貼片質(zhì)量不良會(huì)影響總的有效spot數(shù)等;而透化不合理會(huì)導(dǎo)致spot的reads數(shù)、基因中位數(shù)等參數(shù)。而 在特異性基因表達(dá)方面,我們也可以統(tǒng)計(jì)空間轉(zhuǎn)錄組群體的特異性基因表達(dá)即Markergene,將他們?cè)诮M織切片以及空轉(zhuǎn)上進(jìn)行著色。我們也可以對(duì)于任意一個(gè)已知的基因或者數(shù)據(jù)庫(kù)中的一些細(xì)胞Marker,然后將其在基因表達(dá)在空間轉(zhuǎn)錄組的切片以及HE染色上展示自己的基因表達(dá)進(jìn)而了解,群體中的可能的細(xì)胞組成關(guān)系。 北京ATAC測(cè)序公司烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測(cè)序服務(wù)。

單細(xì)胞測(cè)序是指針對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,可精確地描述每一個(gè)細(xì)胞的狀態(tài),在異質(zhì)性發(fā)育過(guò)程中具有不可忽視的應(yīng)用價(jià)值。然而,單細(xì)胞測(cè)序無(wú)法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,對(duì)于揭示發(fā)育過(guò)程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測(cè)序,可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的加入,無(wú)疑讓單細(xì)胞測(cè)序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是在單細(xì)胞水平上高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,組織解離后,單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-20000個(gè)細(xì)胞, 基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序,獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類型,可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,反映細(xì)胞間的異質(zhì)性。而2021年橫空出世的10X Genomics Chromium X平臺(tái)實(shí)現(xiàn)了單塊chip上的百萬(wàn)級(jí)別通量的細(xì)胞捕獲,系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)16個(gè)通道同時(shí)運(yùn)行,每個(gè)通道可捕獲2000-20000個(gè)細(xì)胞(不混樣),并支持原Chromium Controller體統(tǒng)外的多種細(xì)胞捕獲百萬(wàn)級(jí)別通量實(shí)驗(yàn),可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類型和適配大規(guī)模單細(xì)胞研究。搭建多種測(cè)序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺(tái),5000+項(xiàng)目檢驗(yàn),真實(shí)可信賴。

當(dāng)下,單細(xì)胞測(cè)序已經(jīng)廣泛應(yīng)用于多種疾病發(fā)展過(guò)程中的關(guān)鍵過(guò)程和事件,如疾病從輕癥病變向惡性的轉(zhuǎn)化、惡性向轉(zhuǎn)移病變的發(fā)展,以及疾病對(duì)多種藥物的反應(yīng)等等。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)作為一個(gè)需要將組織解離成為單細(xì)胞懸液,或者是采用細(xì)胞核捕獲的策略捕獲單細(xì)胞核,進(jìn)而對(duì)于每一個(gè)單細(xì)胞或者細(xì)胞核進(jìn)行測(cè)序得到結(jié)果的技術(shù),其空間定位信息是丟失的。這就衍生出了一個(gè)問(wèn)題就是如果單細(xì)胞A與B并不出現(xiàn)在一個(gè)組織區(qū)域中他們會(huì)互相影響或者轉(zhuǎn)化么?免疫研究中,兩個(gè)具有非常強(qiáng)的PDL1-PD1的配對(duì)關(guān)系的細(xì)胞在組織切片上風(fēng)馬牛不相及,這樣PDL1-PD1的關(guān)系會(huì)生效么?截至2021年10月,烈冰助力發(fā)表單細(xì)胞測(cè)序文章近20篇。武漢空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)機(jī)構(gòu)

測(cè)序的革新讓科學(xué)研究從個(gè)體基因差異逐漸轉(zhuǎn)為個(gè)體細(xì)胞的基因差異。南京BD單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

免疫組庫(kù)是功能相似的n多細(xì)胞的統(tǒng)稱。而“免疫”是指免疫細(xì)胞,特指T/B淋巴細(xì)胞。“So~免疫組庫(kù)”(Immune Repertoire,IR),指某個(gè)體,特定時(shí)間點(diǎn)下,所有功能多樣性T/B淋巴細(xì)胞的總和。T/B細(xì)胞利用細(xì)胞表面受體(TCR/BCR)識(shí)別和結(jié)合抗原,介導(dǎo)機(jī)體產(chǎn)生針對(duì)性的免疫應(yīng)答,發(fā)揮免疫功能并做好記錄備案,如果該抗原再次入侵可迅速作出反應(yīng),作為健康衛(wèi)士守護(hù)肌體城池?;蚱蜼(D)J (Variable-可變區(qū); Diversity-多樣區(qū); joining-連接區(qū);) 會(huì)發(fā)生隨機(jī)重組,各基因片段可變形式分別為,V區(qū)(52種),D區(qū)(2種),J區(qū)(13種),配合V(D)J片段中堿基的插入和缺失,進(jìn)一步相互間的排列組合存在1012種以上組合形式,以此構(gòu)成了TCR和BCR多樣性的來(lái)源,而這種多樣性正是適應(yīng)性免疫系統(tǒng)能夠識(shí)別眾多抗原的基礎(chǔ)。南京BD單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,以科技創(chuàng)新實(shí)現(xiàn)高品質(zhì)管理的追求。烈冰生物作為生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開(kāi)發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查、民意測(cè)驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計(jì)算機(jī)、軟件及耗材(除專控),軟件開(kāi)發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】的企業(yè)之一,為客戶提供良好的單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序。烈冰生物繼續(xù)堅(jiān)定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路,既要實(shí)現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長(zhǎng),又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域,實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。烈冰生物創(chuàng)始人陳岱,始終關(guān)注客戶,創(chuàng)新科技,竭誠(chéng)為客戶提供良好的服務(wù)。