空間轉錄組（Spatial Transcriptomics）就是將基因的表達情況與關注的組織切片的免疫化學染色圖像進行整合，從而將組織內不同細胞的基因表達信息定位到組織的原始空間位置上去，進而直接觀測組織中不同部位功能區(qū)基因表達的差異?？臻g轉錄組技術利用了常規(guī)的原位技術和組學技術兩方面的優(yōu)勢。目前已發(fā)表的關于空間轉錄組技術有主要有 Spatial Transcriptomics, Slide-seq, LCM-seq, seqFISH, MERFISH, Liver single cell zonation, Geo-seq 和 Tomo-seq, 涉及物種有人、小鼠、果蠅、秀麗隱桿線蟲、斑馬魚、擬南芥、楊樹和云杉等?？臻g轉錄組這對于發(fā)育生物學等眾多領域的研究都具有重要的意義。甘肅空間轉錄組報價

10x Genomics空間轉錄組技術的準確性高嗎？下圖是一個將10x Genomics空間轉錄組技術應用于小鼠海馬體研究的案例。A圖為腦組織切片的HE染色結果，從10x Genomics空間轉錄組分析結果中，可以清晰看到Tmsb4x（B圖）和Selenow（C圖）在海馬體區(qū)域高表達，和已知的研究結果一致性較高。開展10x Genomics空間轉錄組需要做哪些準備？空間轉錄組是一項十分前沿的技術，涉及到很多細節(jié)方面的準備工作，例如組織類型的選擇、前期預實驗的設計、病理區(qū)域的確認等一系列內容。而且實驗中存在很多不確定性因素，處理不慎容易導致整個項目失敗。海南空間轉錄組做什么分享歐易生物在空間轉錄組樣本處理、實驗和數據挖掘上的成功經驗，助力各位科研工作者取得新的突破。

空間轉錄組的應用有哪些？一、發(fā)現(xiàn)疾病的空間異質性：同時了解患病組織中的細胞類型及其定位有助于解決空間分辨的轉錄組學問題。在不同的環(huán)境下，明智地選擇這些方法在生物學研究中也是至關重要的，例如在神經科學中，基于FISH的方法很普遍；基于LCM的方法適用于小樣本（例如臨床樣本）以及整個轉錄組或基因組分析。二、構建空間轉錄組圖譜：借助于空間分辨的單細胞轉錄組學，建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結構的重要步驟。目前的多項研究通過單細胞轉錄組技術結合空間轉錄技術，得到多個***的時空轉錄組圖譜（相關研究后續(xù)會在如下專輯更新）。

10xVisium空間轉錄組技術原理為將新鮮冷凍的組織切片，置于文庫制備載玻片上，經過固定、染色和透化后，釋放出mRNA，mRNA與空間條形碼捕獲探針相結合，從而捕獲基因表達信息。然后將捕獲的mRNA合成cDNA并制備測序文庫進行測序，并對數據進行可視化分析?？臻g轉錄組技術作為當今**前沿的科研技術，相信很多老師都希望將其運用于自己的課題中，快速發(fā)表高分文章。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執(zhí)行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。從實驗到分析一站式掌握空間轉錄組流程及原理。

空間轉錄組是在組織原位檢測基因表達的一種技術，與bulk RNA-seq或單細胞轉錄組測序相比，空間轉錄組避免了組織中細胞位置信息的丟失，使得我們在檢測基因表達的同時獲得基因在組織內部的空間位置信息。已發(fā)表的關于空間轉錄組技術有Slide-seq , LCM-seq , seqFISH, MERFISH , Liver single cell zonation , Geo-seq and Tomo-seq。這些方法或是在細胞數量上限制較大，或是存在有效測序深度不足等問題。正是由于空間轉錄組可以從多維度解析生物學過程的特點，近年來關于空間轉錄組無論是在技術開發(fā)，還是大規(guī)模應用或商業(yè)化，都得到蓬勃發(fā)展。

了解空間轉錄組樣本準備注意事項。湖南發(fā)展空間轉錄組

空間轉錄組可以進行細胞間通訊分析，區(qū)別在于空間位置信息可以同時用于識別潛在的細胞間相互作用。甘肅空間轉錄組報價

如果只是通過空間轉錄組或者單細胞轉錄組，研究人員在兩個樣本中均可以發(fā)現(xiàn)淋巴細胞相關基因或者淋巴細胞群，無法解釋兩個樣本預后之間的差異。但是通過空間轉錄組，就能很清晰看到兩個樣本之間的差異。作者借助空間轉錄組測序技術探究人類心臟在發(fā)育過程中的基因表達特征和細胞圖譜變化，發(fā)現(xiàn)對于每個發(fā)育階段的不同解剖區(qū)域，都有獨特的基因表達特征。結合單細胞轉錄組測序技術，作者進一步確定和豐富了胚胎心臟基因表達的空間注釋信息。 甘肅空間轉錄組報價

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