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杭州載體整合位點(diǎn)技術(shù)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2024-05-12

慢病毒整合事件要素及檢測方法要求:對于食藥監(jiān)局指導(dǎo)性文件和既往研究內(nèi)容,我們不難發(fā)現(xiàn)對于慢病毒整合檢測所謂整合事件至少包含三個要素:整合位置;整合方向;特定整合位置和整合方向的juedui克隆數(shù)目;因此檢測在定性和定量性能方面都有要求,檢測方法需要結(jié)合臨床樣本進(jìn)行分析性能進(jìn)行系統(tǒng)驗(yàn)證。慢病毒整合位點(diǎn)檢測方法,目前檢測慢病毒整合位點(diǎn)的主要平臺為高深度測序(NGS)。而目前較為成熟已經(jīng)應(yīng)用于工業(yè)產(chǎn)品檢測及臨床研究的整合位點(diǎn)富集建庫方法為機(jī)械片段化及依賴于接頭的擴(kuò)增子建庫(LM-PCR,如INSPIIRED),已經(jīng)應(yīng)用于多個CART19臨床項(xiàng)目的安全性評估及與CAR-T細(xì)胞增值相關(guān)的回顧yao效學(xué)分析。在靶向CD19的CAR-T臨床試驗(yàn)中,慢病毒傳染的CAR-T整合位點(diǎn)顯示出更的抗效力。杭州載體整合位點(diǎn)技術(shù)

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當(dāng)產(chǎn)品預(yù)期的活性成分可以明確時(shí),申請人往往選擇較能代預(yù)期活性的特定細(xì)胞亞群來描述產(chǎn)品劑量,例如,很多導(dǎo)入外源基因的免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品中的載體陽性細(xì)胞數(shù)。在這種情況下,申請人還應(yīng)描述載體陽性細(xì)胞數(shù)與其它細(xì)胞成分的比例,并分析轉(zhuǎn)導(dǎo)效率對患者安全性及有效性的影響。劑量遞增,在惡性liu患者中開展早期探索性臨床試驗(yàn)時(shí),申請人經(jīng)常選擇3+3、改良毒性概率區(qū)間(mTPI)和貝葉斯比較好區(qū)間(BOIN)等設(shè)計(jì)。對于shou次開展人體臨床研究的免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品,在選擇劑量探索試驗(yàn)每個劑量組的樣本量以及組間劑量增幅時(shí),還應(yīng)考慮非臨床研究及類似產(chǎn)品的臨床經(jīng)驗(yàn)中劑量變化對受試者安全性和有效性的影響。江蘇載體整合位點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室目前,基因整合位點(diǎn)主要通過PCR方法分離并經(jīng)測序鑒定。

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全基因組測序是對重組細(xì)胞的基因組DNA進(jìn)行深度測序,技術(shù)成熟簡單這里不做介紹了,我們分享一下LM-PCR結(jié)合二代測序的檢測方法。LM-PCR全稱連接介導(dǎo)的PCR。將含有慢病毒插入的基因組進(jìn)行隨機(jī)打斷并連接接頭,然后通過兩輪PCR富集含有慢病毒LTR-宿主區(qū)域的嵌合序列。此擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行二代測序即可以分析確定載體在宿主基因組上的整合位點(diǎn)。LM-PCR與高通量測序技術(shù)相結(jié)合后,有了更為豐富的應(yīng)用場景。比如,識別整合載體(慢病毒載體,轉(zhuǎn)座子)的整合位點(diǎn)。該技術(shù)廣泛應(yīng)用于基因zhiliao研究基因修飾細(xì)胞的克隆組成,或者通過研究整合事件評估新載體系統(tǒng)的生物安全性。

2020年9月發(fā)布的《細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品申請臨床試驗(yàn)藥學(xué)研究和申報(bào)資料的考慮要點(diǎn)》“生產(chǎn)工藝開發(fā)的技術(shù)要求”及“質(zhì)量研究和質(zhì)量控制中的安全性研究”部分要求提供目的基因在染色體中的整合情況及提供細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化(成瘤性和致瘤性)進(jìn)行安全性研究和評估內(nèi)容。2020年2月發(fā)布的《免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品臨床試驗(yàn)技術(shù)指導(dǎo)原則(試行)》中規(guī)定:探索性臨床試驗(yàn)的安全性和耐受性要考慮"外源基因隨機(jī)整合到細(xì)胞基因組形成插入突變,導(dǎo)致成瘤性和惡性轉(zhuǎn)化等"。非病毒定點(diǎn)整合CAR-T技術(shù)的開發(fā)和應(yīng)用。

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生殖毒性基因zhiliao產(chǎn)品應(yīng)根據(jù)受試物的產(chǎn)品類型、作用機(jī)制、一般毒理發(fā)現(xiàn)、生物分布特征以及患者人群來評估潛在的生殖/發(fā)育毒性風(fēng)險(xiǎn)。生殖毒性試驗(yàn)的研究策略和風(fēng)險(xiǎn)評估可參考ICHS5(R3)的建議和ICHM3(R2)、S6及S9中的相關(guān)內(nèi)容。通常需要開展胚胎-胎仔發(fā)育毒性和圍產(chǎn)期毒性研究,除非有基于具體產(chǎn)品類型的特殊考慮并具有科學(xué)合理性。如果基因zhiliao產(chǎn)品擬用于有生育可能或妊娠人群,應(yīng)研究產(chǎn)品對胎兒的影響(例如細(xì)胞因子局部生成后通過胎盤轉(zhuǎn)運(yùn)),開展胚胎-胎仔發(fā)育和圍產(chǎn)期毒性試驗(yàn)。如果在一般毒理學(xué)試驗(yàn)中發(fā)現(xiàn)有潛在的生殖qiguan毒性反應(yīng),應(yīng)開展生育力和早期胚胎發(fā)育毒性試驗(yàn)。整合位點(diǎn)報(bào)告,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。病毒載體整合位點(diǎn)政策

迎細(xì)胞基因浪潮,整合位點(diǎn)分析方法來助力。杭州載體整合位點(diǎn)技術(shù)

長期隨訪獲得的臨床經(jīng)驗(yàn)以及基因組整合位點(diǎn)分析方法的明顯改進(jìn),都有助于更好地理解整合性基因zhiliao載體相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)。很多能夠介導(dǎo)外源基因轉(zhuǎn)入細(xì)胞核的載體(如逆轉(zhuǎn)錄病毒載體、轉(zhuǎn)座子元件和基因編輯產(chǎn)品等)有基因組整合潛力,需要通過長期隨訪觀察遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn);基因組整合性或者脫靶活性的分析通常需采用有創(chuàng)性12檢測方法取得樣本,實(shí)施時(shí)還需要考慮技術(shù)和倫理上的可行性,例如靶向視網(wǎng)膜或肝臟等組織的基因zhiliao產(chǎn)品,可能難以對靶細(xì)胞采樣,這種情況下可能需要通過密切的臨床隨訪等方式間接評估風(fēng)險(xiǎn);同時(shí),選擇易于采樣的替代細(xì)胞也可能提供關(guān)于相關(guān)信息,例如靶向骨髓造血干細(xì)胞的基因zhiliao產(chǎn)品,可以通過采集外周血細(xì)胞或富集外周血干細(xì)胞進(jìn)行觀察。杭州載體整合位點(diǎn)技術(shù)