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浙江蛋白質磷酸化修飾組學一般流程

來源: 發(fā)布時間:2022-01-14

蛋白質乙?;揎椊M學技術:乙?;揎検求w內(nèi)保守的可逆轉的蛋白修飾,對細胞核內(nèi)轉錄調控因子的刺激有著重要的作用。此外,還存在的非組蛋白乙?;揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調節(jié)。采用肽段預分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙?;b定的影響,再結合免疫共沉淀通過抗體富集乙?;碾亩?,從而實現(xiàn)乙?;蔫b定及定量。樣品要求:1、SDS-PAGE條帶:5個以上可見考染條帶。2、溶液(目標蛋白質):目標蛋白總量>50μg,目標蛋白濃度>80%。3、溶液(大規(guī)?;旌系鞍踪|):蛋白總量>1mg,蛋白濃度>1μg/μl。通過蛋白質翻譯后修飾也進一步增加了細胞通路機制和生命活動的多樣性和復雜性。浙江蛋白質磷酸化修飾組學一般流程

蛋白質磷酸化修飾鑒定方法:質譜鑒定法:在質譜分析中,先使試樣中各組分電離生成不同荷質比的離子,然后經(jīng)加速電場的作用,生成離子束,進入質量分析器。在質量分析器中,在磁場的作用下,質荷比相同的離子會被聚焦到同一點上,不同質荷比的離子聚焦于不同點上,因此獲得區(qū)分不同質荷比離子的質譜圖。與未經(jīng)修飾的肽段相比,磷酸基團修飾的肽段在相對分子質量上就會增加79.983,由此在質譜圖中能夠與未修飾肽段進行區(qū)分。固相金屬離子親和色譜利用的是磷酸基團與固相化的金屬離子有高親和力,可有效吸附磷酸化基團,從而達到富集磷酸化肽段的效果。鰲合底物上的金屬離子通常是Fe3+或Ga3+,可以選擇性地與磷酸化肽中的磷酸部分相結合,并且在高pH或磷酸緩沖液中磷酸化肽可以釋放出來。但是這個方法不能夠有效富集不與IMAC結合的磷酸化肽段。浙江蛋白質磷酸化修飾組學一般流程質譜是蛋白質翻譯后修飾檢測的常用技術之一。

蛋白質乙?;揎椂x:蛋白質在細胞中經(jīng)過翻譯后,到被運輸?shù)较鄳募毎鞑⑶野l(fā)生特定的生物學作用前會經(jīng)過很重要的一步加工,那就是蛋白質翻譯后修飾加工。蛋白質翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質的活性、定位或功能。通過蛋白質翻譯后修飾也進一步增加了細胞通路機制和生命活動的多樣性和復雜性。常見的蛋白質翻譯后修飾包括磷酸化,乙?;腔?,泛素化等。蛋白質乙?;揎棧櫭剂x指的就是在蛋白質原有基礎上面嫁接上乙?;鶊F。在細胞中,乙酰化修飾的反應由乙?;D移酶所催化,將乙酰輔酶A的乙?;D移并添加在蛋白質賴氨酸殘基上。在早期的研究中,乙酰化修飾一直被認為是真核細胞所特有的一種翻譯后修飾,直到后來研究發(fā)現(xiàn)原核細胞中年也存在著蛋白質乙?;揎?。所以,乙?;揎検窃撕驼婧松锼灿械囊环N翻譯后修飾類型。

蛋白質學組翻譯后修飾自下而上分析策略:常用的糖蛋白分離和富集技術有:a. 凝集素親和技術;b. 肼化學富集;c. 親水性相互作用色譜法;d. β-消除/邁克爾加成反應?;谫|譜的糖蛋白鑒定和糖基化位點測定方法有:a. PNGase F酶法;b. Endo H酶法;c. 三氟甲烷磺酸(TFMS)法。泛素化:泛素是一種由76個氨基酸組成的多肽,在真核生物中高度保守,可通過異肽鍵與目標蛋白賴氨酸殘基的氨基進行共價連接。泛素化蛋白的富集主要基于標記,泛素用親和標簽(通常為6xHis)進行標記,并通過鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端為Arg-Gly-Gly結構,經(jīng)胰蛋白酶水解后,Gly-Gly保留在修飾蛋白的肽鏈上,使肽的質量增加114,因此可作為泛素定位位點的質量標記。用HPLC對樣品進行預分離,使用針對特定殘留結構的抗體富集泛素化肽,可很大程度上提高泛素化蛋白的濃度。串聯(lián)質譜可以鑒定泛素化位點。乙?;揎検求w內(nèi)保守的可逆轉的蛋白修飾。

蛋白質翻譯后修飾在蛋白質中磷酸化位點分析時應該注意些什么問題?覆蓋率:覆蓋率越高,檢測和鑒定含有修飾基團的肽幾率就越大。修飾位點的占有率:被修飾的蛋白質的百分比低,則檢測到修飾肽的機會會隨之減少。如果百分比較高(> 30%),則有助于識別修飾位點。棕櫚?;鞍仔揎椯|譜鑒定方法:S-棕櫚?;闹饕δ苁谴龠M蛋白質與細胞膜的結合。蛋白質可以由一個棕櫚?;M成,也可以與更多棕櫚基或與其他脂質,如豆蔻?;?。由于對S-棕櫚?;鞍追治鋈匀痪哂刑魬?zhàn)性,由于S-棕櫚?;揎椀鞍讈喫揭约笆杷院蜐撛诓环€(wěn)定的硫代質鏈的S-脂?;摹,F(xiàn)在常用的幾種方法可以捕獲S-脂?;鞍滓约皩δ繕诵揎椀鞍走M行捕獲。目前對乙酰化修飾的功能研究主要集中在對細胞轉錄調控,以及對代謝通路的調控這兩個方面。武漢丙二?;揎椀鞍踪|組學價格

各種蛋白質翻譯后修飾在信號通路和網(wǎng)絡中發(fā)揮著重要的作用。浙江蛋白質磷酸化修飾組學一般流程

蛋白質有哪些翻譯后修飾?作用機制和生物學功能是什么?前體蛋白是沒有活性的,常常要進行一個系列的翻譯后加工,才能成為具有功能的成熟蛋白。加工的類型是多種多樣的,一般分為以下幾種:N-端fMet或Met的切除、二硫鍵的形成、化學修飾和剪切。當合成蛋白質時,20種不同的氨基酸會組合成為蛋白質。蛋白質的翻譯后蛋白質其他的生物化學官能團(如醋酸鹽、磷酸鹽、不同的脂類及碳水化合物)會附在蛋白質上從而改變蛋白質的化學性質,或是造成結構的改變(如建立雙硫鍵),來擴闊蛋白質的功能。再者,酶可以從蛋白質的N末端移除氨基酸,或從中間將肽鏈剪開。舉例來說,胰島素它會在建立雙硫鍵后被剪開兩次,并在鏈的中間移走多肽前體,而形成的蛋白質包含了兩條以雙硫鍵連接的多肽鏈。浙江蛋白質磷酸化修飾組學一般流程

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