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廣州代謝組學

來源: 發(fā)布時間:2022-01-04

代謝組學概念:基因與蛋白質(zhì)的表達緊密相連,而代謝物則更多地反映了細胞所處的環(huán)境,這又與細胞的營養(yǎng)狀態(tài),藥物和環(huán)境污染物的作用,以及其它外界因素的影響密切相關(guān)。因此有人認為,“基因組學和蛋白質(zhì)組學告訴你什么可能會發(fā)生,而代謝組學則告訴你什么確實發(fā)生了?!贝x組學的概念來源于代謝組,代謝組是指某一生物或細胞在一特定生理時期內(nèi)所有的低分子量代謝產(chǎn)物,代謝組學則是對某一生物或細胞在一特定生理時期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物同時進行定性和定量分析的一門新學科。它是以組群指標分析為基礎(chǔ),以高通量檢測和數(shù)據(jù)處理為手段,以信息建模與系統(tǒng)整合為目標的系統(tǒng)生物學的一個分支。什么是非靶向代謝組學、靶向代謝組學?廣州代謝組學

代謝組學的研究領(lǐng)域有哪些?1、疾病機制研究。2、疾病診斷與防治。3、新藥篩選和開發(fā)。4、藥物作用機制的研究。5、藥物毒性評價。6、植物的細胞代謝組學研究。7、微生物代謝組學研究。代謝組能夠檢測到的代謝物含量是多少?不同檢測平臺的靈敏度不一樣,靈敏度比較高,可達到fM級。另外,相同含量的不同物質(zhì),由于自身化學性質(zhì)不同,質(zhì)譜的離子化效率、信號響應(yīng)強度會差異很大。物質(zhì)的檢測靈敏度跟自身的化學性質(zhì)有關(guān),化學性質(zhì)的影響主要表現(xiàn)在離子化效率和質(zhì)譜碎裂行為兩方面。因此,相同含量的不同物質(zhì),可能一個能檢測出來,另一個檢測不出來。貴陽脂質(zhì)代謝組學多鑒定代謝組學的研究處于生物信息流的中游。

LC-MS非靶向代謝組學:LCMS非靶向是通過液質(zhì)聯(lián)用(LC–MS)方法檢測生物體受擾動或刺激前后大量代謝產(chǎn)物的動態(tài)變化,從中找出表達差異的代謝物,進而闡明生物體代謝相關(guān)過程的代謝組學技術(shù)。LCMS非靶向代謝組學適用于分析難揮發(fā)或熱穩(wěn)定性差的代謝產(chǎn)物,具有高通量、高分辨率、高靈敏度的特點。超高壓液相色譜或超高效液相色譜(UPLC)通過采用更小粒徑的色譜填料配合更高的壓力,實現(xiàn)了更好的分離,具體包括更高的分離能力、更快的分離速度以及更好的靈敏度;串聯(lián)質(zhì)譜儀在MS掃描模式下,可實現(xiàn)高低碰撞能量快速切換,同時采集代謝物的一二級質(zhì)譜信息,結(jié)合代謝組學數(shù)據(jù)處理軟件對質(zhì)譜信息的解析,在單次分析中可檢測和鑒定幾百至幾千種代謝物。

代謝組學研究方法: 對于代謝產(chǎn)物來說,不只只有質(zhì)譜峰這個特征。更進一步說,質(zhì)譜(MS)并不能檢測出所有的代謝產(chǎn)物,并不是因為質(zhì)譜的靈敏度不夠,而是由于質(zhì)譜只能檢測離子化的物質(zhì),但有些代謝產(chǎn)物在質(zhì)譜儀中不能被離子化。采用核磁共振(NMR)的方法,可以彌補色譜的不足。過去,只有毒理學方面的研究使用核磁共振,而質(zhì)譜只在植物代謝研究中采用。如今,這兩種方法在代謝組學研究中已經(jīng)普遍使用。為在不同樣品間進行有意義的比較,研究人員必須結(jié)合使用這兩種方法獲得的大量數(shù)據(jù)進行分析。此外,還需要結(jié)合基因組學研究獲得的數(shù)據(jù)。代謝組學有哪些特點?

代謝組學樣品收集方法及所需樣本量是什么?根據(jù)不同的檢測要求,需要配合不同的樣本量和樣本采集方法,常規(guī)的方法和單個樣本量如下:(1) 微生物和細胞樣本:細胞迅速猝滅細胞并冷凍保存;單個樣本細胞數(shù)量要求10^6。(2) 動物體液(如尿、血、組織、唾液):采樣后要迅速預(yù)處理,如加入抗凝血劑、防腐劑,并立即冷凍處理(-80 ℃);單個樣本要求體積為10μL。(3) 植物樣本:采集后迅速冷凍(液氮),然后轉(zhuǎn)入-80℃保存,單個樣本要求質(zhì)量為50mg。代謝組學是用來解決什么問題的?上海非靶向代謝組學分析方法

代謝組學關(guān)注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。廣州代謝組學

靶向代謝組學:靶向代謝組學(Targeted Metabolomics)是代謝組學研究的重要組成部分,也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對于全代謝組分析而言,靶向代謝組分析具有特異性強,檢測靈敏度高和定量準確等幾個特點。通過對血液、尿液或其他體液以及組織中某一特定的代謝物的富集與準確定量定性分析,一方面可以結(jié)合其它實驗數(shù)據(jù)揭示相關(guān)的分子生物學作用機制,另一方面,也可以為后續(xù)代謝分子標志物的深入研究和開發(fā)利用提供有力支持。靶向代謝組學可以用于:驗證有非靶向代謝組學實驗提出的假說;進行基于假說的探索性實驗,針對特定代謝物,研究代謝模型。廣州代謝組學

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