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武漢Label free多肽組學方法

來源: 發(fā)布時間:2022-05-16

蛋白質(zhì)組學介紹:蛋白質(zhì)組學,指對某一基因組所表達的所有蛋白質(zhì)及其特征進行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究,以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網(wǎng)絡。研究的內(nèi)容主要包括:組成蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)氨基酸的序列特征、蛋白質(zhì)的豐度、蛋白質(zhì)活性、蛋白質(zhì)的修飾、亞細胞定位和三維結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)之間的相互作用以及對蛋白質(zhì)的高階復合物結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)組主要通過蛋白質(zhì)雙向電泳、氨基酸序列測定、質(zhì)譜、生物信息等方法,研究某個基因組對應的所有蛋白質(zhì)特征,包括蛋白質(zhì)含量、亞細胞定位、活性以及蛋白修飾等內(nèi)容。蛋白質(zhì)組學在醫(yī)療和健康方面有什么應用?武漢Label free多肽組學方法

蛋白質(zhì)組學在醫(yī)療和健康方面有什么應用?具體而言,蛋白質(zhì)組學在此類應用中,更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息。作為檢測手段的蛋白質(zhì)組學:事實上,在當前的生物醫(yī)學研究和臨床診斷中,蛋白質(zhì)組學相關(guān)技術(shù)有非常多的應用。因為蛋白質(zhì)組學技術(shù)的本質(zhì)(從分析化學角度來看),就是對蛋白質(zhì)的定性定量分析。生物醫(yī)學和臨床診斷中,需要大量表征一種或多種蛋白質(zhì)的含量、氨基酸序列、翻譯后修飾等信息。蛋白質(zhì)組學相關(guān)技術(shù)目前在一小部分]應用中具有獨特優(yōu)勢。有很多蛋白質(zhì)組學的研究者在工業(yè)界和醫(yī)院進行相關(guān)研究和日常工作。很容易發(fā)現(xiàn),當前蛋白質(zhì)組學的臨床應用更多地集中在第二類。第1類的應用更接近于生物醫(yī)學基礎研究,目前還沒有和大部分人的現(xiàn)實生活產(chǎn)生關(guān)系。哈爾濱DIA定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)服務蛋白質(zhì)組學技術(shù)并帶領生物技術(shù)取得關(guān)鍵性的突破。

什么樣本能做蛋白組學檢測?大概可以測到多少的蛋白種類?原則上只要能提取到蛋白,就可以做蛋白組檢測。樣本測到的蛋白種類跟數(shù)據(jù)庫和樣本本身蛋白濃度有關(guān),一般數(shù)據(jù)庫越大,可以鑒定到的蛋白質(zhì)數(shù)量越多。也與樣本的類型有關(guān),通常,組織細胞相比于體液樣本,能夠鑒定到更多的蛋白。蛋白組學樣本寄送前是否需要精確計數(shù)或是稱量?不同樣本寄送會有不同的送樣要求,按照收集方法提供可以保證實驗用量充足。不需要精確計數(shù)或是稱量,項目開展前會進行蛋白濃度的測定,后續(xù)也是不同樣本等蛋白量處理、上機檢測,但是要保證每個樣本的寄樣量達到實驗要求。

蛋白質(zhì)組學研究內(nèi)容有什么?對人類而言,蛋白質(zhì)組學的研究要服務于人類的健康,主要指促進分子醫(yī)學的發(fā)展。如尋找藥物的靶分子。很多藥物本身就是蛋白質(zhì),而很多藥物的靶分子也是蛋白質(zhì)。藥物也可以干預蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。在基礎醫(yī)學和疾病機理研究中,了解人不同發(fā)育、生長期和不同生理、病理條件下及不同細胞類型的基因表達的特點具有特別重要的意義。這些研究可能找到直接與特定生理或病理狀態(tài)相關(guān)的分子,進一步為設計作用于特定靶分子的藥物奠定基礎。iTRAQ定量是目前定量蛋白質(zhì)組學應用比較普遍的技術(shù)。

蛋白組學常見研究模式主要有兩種:1.通過蛋白質(zhì)組學尋找疾病發(fā)生的發(fā)展的新型標志物;2.結(jié)合其它組學建立疾病或者研究主題的表達譜和分子機制。蛋白質(zhì)組學( proteomics) 是指系統(tǒng)研究某一基因組所表達的所有蛋白質(zhì),包括組成蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的氨基酸序列,蛋白質(zhì)的豐度,蛋白質(zhì)的修飾以及蛋白質(zhì)之間的相互作用。蛋白質(zhì)組和基因組( genome)在概念上有相關(guān)性,表示某一個蛋白質(zhì)組的蛋白質(zhì)是由基因組所編碼的,然而蛋白質(zhì)組學和基因組學在研究對象和研究方法上有很大的區(qū)別。定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)主要分為標記(label)和非標記(label free)定量策略。山東PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學應用

蛋白質(zhì)組研究技術(shù)涉及到各種重要的生物學現(xiàn)象,如信號轉(zhuǎn)導、細胞分化、蛋白質(zhì)折疊等。武漢Label free多肽組學方法

蛋白質(zhì)組學常用技術(shù):非靶向蛋白組學:蛋白質(zhì)定性(膠條鑒定和溶液鑒定),高通量定量蛋白組(Labelfree、iTRAQ/TMT和DIA定量),多肽組學。蛋白質(zhì)組研究技術(shù)在研究對象上,覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍。蛋白質(zhì)組學主要以全蛋白組(組織、細胞)、線粒體蛋白組、葉綠體蛋白組和外泌體蛋白組為研究對象,通過對蛋白組進行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析,揭示生物學功能、作用機制、疾病診斷的標志物以及預測蛋白的上、下游變化關(guān)系。蛋白質(zhì)組學可以克服核酸水平預測的不確定性、反映核酸翻譯后修飾情況。武漢Label free多肽組學方法