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四川常規(guī)蛋白質(zhì)組學鑒定

來源: 發(fā)布時間:2022-05-14

蛋白質(zhì)組學技術方法介紹:蛋白質(zhì)組學技術方法:生物質(zhì)譜:生物質(zhì)譜技術是蛋白質(zhì)組學研究中比較重要的鑒定技術,其基本原理是樣品分子離子化后,根據(jù)不同離子之間的荷質(zhì)比(M/E)的差異來分離并確定分子量。對于經(jīng)過雙向電泳分離的目標蛋白質(zhì)用胰蛋白酶酶解(水解Lys或Arg的-C端形成的肽鍵)成肽段,對這些肽段用質(zhì)譜進行鑒定與分析。目前常用的質(zhì)譜包括兩種:基質(zhì)輔助激光解吸電離-飛行時間質(zhì)譜(MALDI-TOF-MS)和電噴霧質(zhì)譜(ESI- MS)。在未來的發(fā)展中,蛋白質(zhì)組學的研究領域?qū)⒏悠毡椤K拇ǔR?guī)蛋白質(zhì)組學鑒定

蛋白組學技術:質(zhì)譜技術相較于傳統(tǒng)蛋白質(zhì)鑒定技術而言,擁有靈敏、準確、高通量、自動化等特點。質(zhì)譜鑒定蛋白質(zhì)的基本原理是先將樣品分子離子化,然后根據(jù)不同離子之間的質(zhì)荷比差異來分離并確定蛋白質(zhì)的相對分子質(zhì)量。根據(jù)蛋白質(zhì)酶解后所得到的肽質(zhì)量指紋圖譜、肽序列標簽、和肽階梯序列去檢索蛋白質(zhì)或核酸序列數(shù)據(jù)庫,質(zhì)譜技術可達到對蛋白質(zhì)的快速鑒定和高通量篩選。因產(chǎn)生離子的方法不同而發(fā)展起來的質(zhì)譜包括基質(zhì)輔助激光解吸離子化質(zhì)譜、電噴霧離子化質(zhì)譜、表面增強激光解吸離子化質(zhì)譜等。河南Label free非標記定量蛋白質(zhì)組學技術在當前的生物醫(yī)學研究和臨床診斷中,蛋白質(zhì)組學相關技術有非常多的應用。

我們究竟怎么研究蛋白質(zhì)組學呢?目前高通量檢測蛋白質(zhì)的方法中,還是首推基于質(zhì)譜的方法,納流液相可以將復雜樣品中的肽段高效地分離,然后依次進入質(zhì)譜,對每個被離子化的肽段及其碎裂后碎片的荷質(zhì)比進行分析,從而得到該肽段的序列信息,然后根據(jù)對應的色譜峰面積或者報告離子強度等信息,我們又可以得到該肽段的定量信息。蛋白組學研究怎么做?當下蛋白組學研究中應用比較普遍的技術是同位素標記定量(iTRAQ/TMT技術)。iTRAQ/TMT技術是利用DDA掃描模式,其掃描的方式是將一級質(zhì)譜信號比較強的Top20的多肽進行二級打碎,然后進入二級質(zhì)譜進行檢測。其優(yōu)勢是二級譜圖采集的肽段信息都來源于同一條多肽,有利于后續(xù)的定性分析。

蛋白質(zhì)組學描述: 蛋白質(zhì)組(proteome):一種細胞、組織或生物體完整基因組所對應的全套蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學(proteomics):研究細胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、變化、定位及相互作用規(guī)律的科學。蛋白質(zhì)譜技術: 蛋白質(zhì)譜技術是蛋白質(zhì)鑒定分析的主要支撐技術,它通過測定樣品離子的質(zhì)荷比(m/z) 來進行成分和結(jié)構(gòu)分析。高靈敏度,精確度;能同時提供樣品的精確分子量和結(jié)構(gòu)信息;既可用于定性分析,也可用于定量分析。標記定量技術原理: 在一級質(zhì)譜圖中,任何一種iTRAQ/TMT試劑標記不同樣本中的同一蛋白質(zhì)表現(xiàn)為相同的質(zhì)荷比; 在二級質(zhì)譜圖中,報告離子表現(xiàn)為不同質(zhì)荷比的峰,因此根據(jù)波峰的高度及面積,可以鑒定出蛋白質(zhì)和分析出同一蛋白質(zhì)不同處理的定量信息。蛋白質(zhì)組研究技術涉及到各種重要的生物學現(xiàn)象,如信號轉(zhuǎn)導、細胞分化、蛋白質(zhì)折疊等等。

蛋白質(zhì)組學:質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組學的基本原理主要是通過測定被測樣品離子的理化性質(zhì)來進行分析,根據(jù)樣品的質(zhì)量譜圖和相關信息從而得到定性和定量結(jié)果。目前,蛋白質(zhì)組學質(zhì)譜分析一般是根據(jù)保留時間(retentiontime)、質(zhì)荷比(m/z)、離子強度(intensity)這三個維度對肽蛋白質(zhì)進行鑒定和定量,即3D蛋白質(zhì)組學。4D蛋白質(zhì)組學在3D蛋白質(zhì)組學的基礎之上增加了第四維度,離子淌度(mobility),主要根據(jù)離子的形狀和截面對離子進行分離,能夠區(qū)分m/z差值非常小的肽段,使低豐度蛋白信號能夠被區(qū)分和識別出來。4D蛋白質(zhì)組學基于timsTOFPro質(zhì)譜儀,結(jié)合PASEF(ParallelAccumulationSerialFragmentation,同步累積連續(xù)碎裂)與TIMS(TrappedIonMobilitySpectrometry,離子遷移譜),可重復測量所有檢測離子的碰撞截面(CCS),能更快、更靈敏的進行蛋白質(zhì)組定性和定量。蛋白質(zhì)組研究技術覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍。四川定量乙?;鞍踪|(zhì)組學技術服務

蛋白質(zhì)組學技術的本質(zhì)(從分析化學角度來看),就是對蛋白質(zhì)的定性定量分析。四川常規(guī)蛋白質(zhì)組學鑒定

蛋白質(zhì)組學樣品寄樣要求:動物組織的樣本蛋白量相對較高,送樣量的要求也相對比較寬松,一般提供50~100mg的量即可。此外,組織上有血跡、脂肪、結(jié)締組織的還需要用PBS和組織剪將其清理干凈。送樣前將樣品用液氮速凍5min,放置在-80℃保存,送樣時需要置于干冰環(huán)境中運輸。動物的懸浮培養(yǎng)細胞也是比較熱門的蛋白組學研究對象,如果想做細胞的蛋白組學,起碼需要1×107個細胞,離心后收集,置于-80攝氏度環(huán)境中。蛋白質(zhì)組學,指對某一基因組所表達的所有蛋白質(zhì)及其特征進行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究,以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網(wǎng)絡。四川常規(guī)蛋白質(zhì)組學鑒定