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河南非靶向代謝組學分析研究

來源: 發(fā)布時間:2022-04-28

非靶向代謝組學分析流程:1、代謝譜分析(也稱為差異表達分析):在一組實驗和對照樣品中,尋找豐度改變有統(tǒng)計學意義的感興趣代謝物;2、鑒定:進行代謝譜分析后,測定這些代謝物的化學結構;3、解釋:研究流程的結尾的一步,解釋所發(fā)現(xiàn)的代謝物與生物過程或生物狀態(tài)之間的關聯(lián)。代謝組學主要是對生物體受到內部(基因)或外部(飲食、環(huán)境等)刺激后所發(fā)生生物響應進行綜合分析的研究工具,代謝組學的研究按照研究目的的不同可分為靶向代謝組學和非靶向代謝組學。代謝組學是用來解決什么問題的呢?河南非靶向代謝組學分析研究

靶向代謝組學的一般分析流程為:1. 數(shù)據(jù)采集 第1步是得到標準品。如果無法從市場上買到,就必須定制合成。然后通過優(yōu)化產(chǎn)物離子碰撞能量以得到的信號,再通過測定三重串聯(lián)四極桿測定代謝物的 MRM 躍遷值。2. 定量 接下來用定量分析軟件對 MRM 數(shù)據(jù)進行處理,得到報告。3. 統(tǒng)計分析和解釋 將定量報告輸入統(tǒng)計分析軟件包,用統(tǒng)計工具,如ANOVA,對數(shù)據(jù)進行處理。靶向分析:在基于質譜的代謝組學分析中,要意識到離子強度和色譜保留時間都會隨著時間的推移而產(chǎn)生漂移,所以在實驗中,要按隨機順序對樣本進行檢測,且數(shù)據(jù)需要在同天同一批次進行采集,以減少誤差。河南非靶向代謝組學分析研究代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似,通常有兩種方法。

GC-MS非靶向代謝組學醫(yī)學分析生物樣本為何要衍生化處理?有哪些衍生化的方法?GC的流動相為氣體(通常為高純氦),這就要求被分析物必須能夠氣化,而生物樣本中很多內源性代謝物都含有極性基團,具有沸點高、不易氣化特點。衍生化能夠降低這些代謝物的沸點,增加它們的熱穩(wěn)定性,以便分析能夠順利進行。衍生化方法及試劑種類繁多,根據(jù)不同的分析目標,需選擇合適的衍生化方法。如分析脂肪酸,我們可以采用甲酯化衍生。在GC/MS代謝平臺上,比較常用的衍生化方法是硅烷化衍生,因為它的廣譜高效。在進行硅烷化衍生之前,還需添加甲氧胺吡啶溶液,以封閉羰基(針對α-酮酸和糖類,保護作用),減少衍生化副產(chǎn)物的生成。

代謝組學概念:代謝組學(metabonomics/metabolomics)是效仿基因組學和蛋白質組學的研究思想,對生物體內所有代謝物進行定量分析,并尋找代謝物與生理病理變化的相對關系的研究方式,是系統(tǒng)生物學的組成部分。其研究對象大都是相對分子質量1000以內的小分子物質。先進分析檢測技術結合模式識別和**系統(tǒng)等計算分析方法是代謝組學研究的基本方法。代謝組學是繼基因組學和蛋白質組學之后新近發(fā)展起來的一門學科,是系統(tǒng)生物學的重要組成部分。代謝組學在食品安全領域,利用代謝組學工具發(fā)現(xiàn)農獸藥等在動植物體內的相關生物標志物也是一個熱點領域。

代謝組學概念:代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000)。 在食品安全領域,利用代謝組學工具發(fā)現(xiàn)農獸藥等在動植物體內的相關生物標志物也是一個熱點領域。其樣品主要是動植物的細胞和組織的提取液。主要技術手段是核磁共振(NMR),質譜(MS),色譜(HPLC,GC),其中以NMR為主。通過檢測一系列樣品的NMR 譜圖,再結合模式識別方法,可以判斷出生物體的病理生理狀態(tài),并有可能找出與之相關的生物標志物(biomarker)。代謝組學的代謝產(chǎn)物是基因表達的產(chǎn)物。江蘇LC-MS/MS非靶向脂質組學技術分析

代謝組學的研究介于基因、蛋白質和細胞、組織之間。河南非靶向代謝組學分析研究

什么是非靶向代謝組學、靶向代謝組學?(1) 非靶向代謝組學(Untargeted metabolomics)即非目標代謝組學或發(fā)現(xiàn)代謝組學,無偏向性地對所有小分子代謝物(一般相對分子量小于1000)同時進行檢測分析的代謝組學。(2) 靶向代謝組學(Trgeted metabolomics)則為目標性代謝組學,著重對于設定好的目標代謝物進行定性、量檢測分析和研究。相比于其他組學,代謝組學有哪些特殊的優(yōu)勢?系統(tǒng)生物學有基因組學、轉錄組學、蛋白組學和代謝組學。代謝組學作為系統(tǒng)生物學的一個重要的分支,與其他組學相比有著其特有的優(yōu)勢,主要體現(xiàn)在以下幾點:(1) 基因與蛋白質表達的微小變化會在相應代謝物水平上得到放大,更容易被檢測。(2) 代謝物的種類要遠小于基因和蛋白的數(shù)目。(3) 可與生物表型變化建立直接相關性。河南非靶向代謝組學分析研究