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蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)分析方法

來源: 發(fā)布時間:2022-03-11

質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾原理:相較于沒有發(fā)生翻譯后修飾的蛋白,翻譯后修飾蛋白會在特定肽段序列有分子量的增加。在蛋白翻譯后修飾方式的質(zhì)譜分析過程中,蛋白會首先被酶切成肽段,然后進(jìn)入質(zhì)譜進(jìn)行分析;通過質(zhì)譜分析,得到的是一系列肽段的相對分子質(zhì)量信息。對于某一個特定的肽段而言,在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下其序列信息和分子量是確定的,當(dāng)它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后,例如磷酸化修飾,因為磷酸根的分子量也是確定的,所以在質(zhì)譜檢測過程中如果發(fā)現(xiàn)部分肽段的分子量剛好增加了一個磷酸根的分子量,則可以假設(shè)這個肽段發(fā)生了磷酸化修飾,再通過二級或多級質(zhì)譜的譜圖進(jìn)行二次確認(rèn)即可實現(xiàn)翻譯后修飾類型鑒定及修飾位點分析等。蛋白質(zhì)修飾可檢測修飾類型有磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化、丙?;?、丁?;?、丙二酰化。蛋白質(zhì)乙酰化修飾組學(xué)分析方法

蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)技術(shù):糖基化是在酶的控制下,蛋白質(zhì)或脂質(zhì)附加上糖類的過程,發(fā)生于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和高爾基體等部位。在糖基轉(zhuǎn)移酶作用下將糖轉(zhuǎn)移至蛋白質(zhì),和蛋白質(zhì)上的氨基酸殘基共價結(jié)合。蛋白質(zhì)經(jīng)過糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化是對蛋白的重要的修飾作用,有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)功能作用。凝素親和法是目前糖蛋白質(zhì)組學(xué)中應(yīng)用普遍的分離富集方法。凝集素(lectin)是一類糖結(jié)合蛋白質(zhì),能專一識別某一特殊結(jié)構(gòu)的單糖或聚糖中特定的糖基序列而與之結(jié)合,它們與糖鏈可逆非共價結(jié)合,糖蛋白或糖肽被凝集素捕獲之后,通常用特定的單糖通過競爭結(jié)合凝集素將糖蛋白或糖肽洗脫下來。蛋白質(zhì)經(jīng)過酶解后利用凝集素(lectin)富集N-糖基化肽段,然后用N-糖酰胺酶(PNGase)在H218O中切除連接在天冬酰胺殘基(Asn)上的糖鏈。哈爾濱丙?;揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)有哪些類型蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)磷酸化修飾具有靈活的特性。

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué):蛋白質(zhì)翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM)是指對翻譯后的蛋白質(zhì)進(jìn)行共價加工的過程。它通過在一個或多個氨基酸殘基加上修飾基團(tuán),可以改變蛋白質(zhì)的物理、化學(xué)性質(zhì),進(jìn)而影響蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象和活性狀態(tài)、亞細(xì)胞定位、折疊及其穩(wěn)定性以及蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的豐度變化在生命活動研究中具有重大意義,異常的翻譯后修飾會導(dǎo)致多種疾病的發(fā)生。質(zhì)譜可以分辨蛋白質(zhì)修飾前和修飾后分子量上的變化,因此只要知道靶蛋白翻譯后修飾前后分子量的變化,就能對翻譯后修飾方式進(jìn)行鑒定和定量。

蛋白質(zhì)有哪些翻譯后修飾?作用機(jī)制和生物學(xué)功能是什么?前體蛋白是沒有活性的,常常要進(jìn)行一個系列的翻譯后加工,才能成為具有功能的成熟蛋白。加工的類型是多種多樣的,一般分為以下幾種:N-端fMet或Met的切除、二硫鍵的形成、化學(xué)修飾和剪切。當(dāng)合成蛋白質(zhì)時,20種不同的氨基酸會組合成為蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)的翻譯后蛋白質(zhì)其他的生物化學(xué)官能團(tuán)(如醋酸鹽、磷酸鹽、不同的脂類及碳水化合物)會附在蛋白質(zhì)上從而改變蛋白質(zhì)的化學(xué)性質(zhì),或是造成結(jié)構(gòu)的改變(如建立雙硫鍵),來擴(kuò)闊蛋白質(zhì)的功能。再者,酶可以從蛋白質(zhì)的N末端移除氨基酸,或從中間將肽鏈剪開。舉例來說,胰島素它會在建立雙硫鍵后被剪開兩次,并在鏈的中間移走多肽前體,而形成的蛋白質(zhì)包含了兩條以雙硫鍵連接的多肽鏈。蛋白質(zhì)磷酸化修飾的免疫印跡技術(shù)優(yōu)點:能夠特異鑒定單個磷酸化位點。

蛋白翻譯后修飾檢測:由于PTMs在基礎(chǔ)生物學(xué)以及疾病發(fā)病機(jī)理中的重要性,因此非常需要對蛋白質(zhì)的翻譯后修飾進(jìn)行檢測。對蛋白翻譯后修飾進(jìn)行研究時通常需要富集步驟,因為這些翻譯后修飾的蛋白質(zhì)相對含量較低。大多數(shù)PTMs的檢測方法與富集策略結(jié)合在一起開發(fā),以提供比較好的機(jī)會來識別、驗證和研究蛋白翻譯后修飾的功能。但是,在檢測已有特異性翻譯后修飾抗體的修飾蛋白質(zhì)時,可能不需要富集步驟。質(zhì)譜技術(shù),通過測定肽段的分子量可以對該肽段的翻譯后修飾情況進(jìn)行檢測,并可以對翻譯后修飾蛋白進(jìn)行定性和定量分析。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的定位。廣東蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)價錢

蛋白質(zhì)糖基化是一種常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾。蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)分析方法

蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用是蛋白質(zhì)發(fā)揮功能的主要機(jī)制之一,在DNA損傷修復(fù),自噬和代謝等過程中都扮演著非常重要的角色,蛋白相互作用異常便會導(dǎo)致疾病的發(fā)生.在蛋白質(zhì)的賴氨酸,絲氨酸和蘇氨酸等氨基酸殘基上,可發(fā)生甲基化,乙?;?磷酸化和泛素化等200多種翻譯后修飾,這些修飾通常能改變蛋白質(zhì)的電性,疏水性和空間結(jié)構(gòu)等屬性,為與之結(jié)合的蛋白提供結(jié)合的錨定或產(chǎn)生位阻效應(yīng),像一把開關(guān)在時空上精確調(diào)控蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的發(fā)生以及動態(tài)變化.結(jié)構(gòu)研究表明,蛋白質(zhì)之間的相互作用通常由臨近的幾個氨基酸殘基直接結(jié)合,替換該區(qū)域的氨基酸殘基,通常能破壞結(jié)合,使其失去部分功能或酶活性,可以針對性地開發(fā)和設(shè)計抑制劑,用于疾病的診療。蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)分析方法

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